关于借条鉴定由谁申请的问题，这并非一个一成不变的答案，而是需要根据具体案情和证据情况来确定。以下是根据不同情形进行的详细分析：
原告仅凭借据起诉的情况：
- 在原告仅依据借据起诉而无其他证据佐证的情况下，如果被告对借据上的签章的真实性提出异议，则通常由原告申请鉴定。这是因为原告作为主张权利的一方，有责任提供足够的证据来支持其主张。如果原告不申请鉴定，法院可能会认定原告的主张不能成立。
原告提交借据及其他佐证材料的情况：
- 如果原告不仅提供了借据，还提供了其他证据予以佐证，使得借据的真实性已经具备一定可信度的情形下，被告质疑借据真实性的，则由被告申请鉴定。这是因为在此情况下，原告已经提供了初步的证据链，被告如需反驳，则需承担进一步的举证责任。
原告仅凭借据起诉，但被告有证据证明借据存在疑点的情况：
- 在原告仅凭借据起诉时，并非当然地由原告申请鉴定。如果被告能提供证据证明借据的真实性存在疑点，那么仍应由原告申请鉴定以消除这些疑点。
特殊规定或司法实践中的做法：
- 某些地方的司法规范文件可能对此有特殊规定，如一律由被告（异议者）申请鉴定。但这并非普遍适用的规则，而是需要根据具体地区的司法实践来确定。
综上所述，借条鉴定的申请责任应根据具体案情和证据情况来确定。在大多数情况下，如果原告仅凭借据起诉，则由原告申请鉴定；如果原告提供了其他佐证材料，使得借据的真实性具备一定可信度，则由被告申请鉴定。同时，也需要注意特殊规定或司法实践中的做法。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。