您好，关于员工下班后发生交通事故是由工伤基金赔偿还是保险公司赔偿的问题，这主要取决于几个关键因素，包括是否认定为工伤以及单位是否为员工缴纳了工伤保险。以下是对这一问题的详细解答：

一、工伤认定

首先，根据《工伤保险条例》的规定，职工在上下班途中受到非本人主要责任的交通事故伤害（这包括同等责任、次要责任和无责任）应当认定为工伤。因此，关键在于事故责任的认定。如果员工在交通事故中负主要责任或全部责任，那么就不能认定为工伤。

二、赔偿责任判定

1. 单位未缴纳工伤保险

• 如果单位没有为员工缴纳工伤保险，并且员工被认定为工伤，那么单位需要按照《工伤保险条例》规定的工伤保险待遇项目和标准，向员工支付全部费用。这些费用涵盖了医疗费用、康复费用、一次性伤残补助金、伤残津贴等多个方面。

2. 单位已缴纳工伤保险

• 如果单位为员工缴纳了工伤保险，并且员工被认定为工伤，那么大部分费用，如医疗费用、一次性伤残补助金、伤残津贴（一至四级）等，将由工伤保险基金支付。
• 然而，单位仍然需要承担一部分责任，包括支付停工留薪期的工资、五级和六级伤残津贴（当员工难以安排工作时），以及在终止或解除劳动合同时支付五至十级伤残员工的一次性伤残就业补助金。

三、总结

综上所述，员工下班后发生交通事故，若被认定为工伤，赔偿责任主要由单位是否缴纳工伤保险来决定。如果单位未缴纳工伤保险，则需要承担全部赔偿责任；如果单位已缴纳工伤保险，则大部分费用由工伤保险基金支付，但单位仍需承担部分特定责任。

希望这个解答能够帮助您更好地理解这个问题，并为您在实际操作中提供指导。如果您还有其他疑问或需要进一步的帮助，请随时告诉我。