对于员工有违规行为没被处罚，后续公司以此追究责任是否合法的问题，需要具体分析：

1. 公司规章制度与劳动合同约定：

   • 如果公司的规章制度或劳动合同中明确规定了某种违规行为及其相应的处罚措施，但公司在员工实施该违规行为后并未及时处罚，那么后续再以此追究责任可能涉及管理上的不规范或不一致性。然而，这并不意味着公司完全丧失了追究责任的权利，特别是如果违规行为造成了公司实际损失或严重影响了公司秩序。
   • 如果规章制度或劳动合同中并未明确规定某种违规行为的处罚措施，或者规定不明确，那么公司在后续追究责任时可能需要更加谨慎，因为缺乏明确的制度依据。

2. 违规行为的性质与后果：

   • 如果员工的违规行为性质严重，如涉及违法、严重违反公司规章制度、造成重大损失等，那么即使公司之前未予处罚，后续也有权根据违规行为的性质和后果进行追究。
   • 如果违规行为性质较轻，且未造成实际损失或影响较小，公司后续再以此追究责任可能面临较大的法律风险和道德质疑。

3. 法律层面：

   • 从法律角度来看，公司追究员工责任需要基于合法的规章制度、劳动合同以及相关法律法规。如果公司能够证明员工确实存在违规行为，且该行为违反了公司规章制度或劳动合同约定，那么公司有权依法追究责任。
   • 但需要注意的是，公司在追究责任时必须遵守相关法律法规，如确保处罚措施的合法性、合理性以及程序的正当性等。

综上所述，员工有违规行为没被处罚，后续公司以此追究责任是否合法，取决于多种因素的综合考量，包括公司规章制度与劳动合同的约定、违规行为的性质与后果以及法律层面的规定。因此，在具体情况下，公司应谨慎评估后再决定是否追究责任，并确保追究过程的合法性和合理性。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。