结论：公司对员工违规行为进行罚款是否合法，需分情况讨论，主要取决于罚款依据、程序及金额是否符合法律规定。

1. 法律框架与基本原则
   根据《劳动合同法》及《工资支付暂行规定》，用人单位并非行政机关，原则上无权对员工进行罚款。但法律允许用人单位通过规章制度对员工行为进行管理，并可设定经济性处罚措施（如扣减绩效、奖金等），前提是该制度需满足以下条件：

   • 合法性：制度内容不得违反法律强制性规定（如最低工资标准、加班费支付等）；
     
   • 民主程序：需经职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表协商确定；
     
   • 公示告知：需向员工公示或送达，确保员工知悉；
     
   • 合理性：罚款金额需与违规行为性质、损失程度匹配，不得滥用。

2. 合法情形下的经济处罚
   若公司规章制度符合上述条件，且处罚措施属于非罚款性质（如扣减绩效工资、奖金），则可能被认定为合法。例如：

   • 员工因故意或重大过失导致公司经济损失，公司可按劳动合同约定要求赔偿，但每月扣减部分不得超过员工当月工资的20%，且扣减后工资不得低于当地最低工资标准；
     
   • 员工违反考勤制度，公司可依据制度扣减全勤奖或绩效分，但不得直接以“罚款”名义扣减基本工资。

3. 违法情形下的罚款
   以下情形可能被认定为违法：

   • 无制度依据：公司未制定合法有效的规章制度，或制度未经过民主程序、公示告知；
     
   • 超出合理范围：罚款金额过高（如单次罚款超过月工资20%），或累计罚款导致员工工资低于最低标准；
     
   • 滥用处罚权：以罚款替代管理，如对轻微违规行为频繁罚款，或罚款与损失不成比例；
     
   • 直接扣减工资：未经员工同意，直接从工资中扣除罚款（除非符合法定赔偿情形）。

4. 员工维权路径
   若公司违法罚款，员工可采取以下措施：

   • 协商解决：与公司沟通，要求退还违法罚款；
     
   • 投诉举报：向当地劳动监察部门投诉，要求查处违法行为；
     
   • 申请仲裁：以公司“克扣工资”为由申请劳动仲裁，要求支付被扣款项及经济补偿。

建议：公司应通过合法合规的规章制度管理员工行为，避免直接使用“罚款”表述，可改为“绩效扣减”“损失赔偿”等。员工若遭遇违法罚款，可保留相关证据（如罚款通知、工资条等）并依法维权。如有具体案件细节，可进一步向我咨询。