车主可通过诉讼方式起诉保险公司不赔偿非医保用药。以下是具体的分析和建议：

一. 起诉依据

1. 保险合同说明义务：根据《中华人民共和国保险法》第十七条，保险人在订立合同时，对于免除其责任的条款，有义务向投保人作出明确说明。如果保险人未作提示或明确说明，该条款不产生效力。因此，如果保险公司以非医保用药为由拒绝赔偿，但未在合同中明确说明或提示，车主有权提起诉讼。
2. 赔偿责任：根据《机动车交通事故责任强制保险条例》第二十一条，保险公司应在机动车交通事故责任强制保险责任限额范围内对受害人进行赔偿，除非事故是由受害人故意造成的。非医保用药如果属于合理且必要的医疗费用，保险公司应予以赔偿。

二. 起诉步骤

1. 收集证据：车主应收集所有与事故相关的证据，包括医疗记录、费用清单、保险合同、拒赔通知书等。
2. 撰写诉状：在诉状中明确列出原告（车主）、被告（保险公司），以及诉讼请求和事实理由。诉讼请求应明确要求保险公司赔偿非医保用药的费用。
3. 提交法院：将诉状及相关证据提交至有管辖权的法院，并缴纳诉讼费。
4. 参与诉讼：按照法院的通知参与庭审，陈述事实和理由，提供证据，进行辩论。

三. 注意事项

1. 及时通知：根据《中华人民共和国保险法》第二十一条，投保人、被保险人或受益人知道保险事故发生后，应及时通知保险人。因此，车主在起诉前应确保已履行了及时通知的义务。
2. 提供证明和资料：根据《中华人民共和国保险法》第二十二条，车主在请求赔偿时，应向保险公司提供所能提供的与确认保险事故的性质、原因、损失程度等有关的证明和资料。

我建议车主在起诉前，先尝试与保险公司进行协商，如果协商无果，再考虑通过法律途径维护自己的权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。