实习手册盖的章和三方协议的章不一样，确实可能会产生一定的关系或影响。下面我详细为你解释一下：
首先，我们要明确实习手册和三方协议各自的作用和意义。实习手册通常用于记录实习生的实习情况、表现以及实习单位的相关信息，而三方协议则是实习生、实习单位和学校三方之间就实习事宜达成的书面协议，具有明确的法律约束力。
从法律效力的角度来看：
- 实习手册上的盖章主要体现的是实习单位对实习生实习情况的确认，它可能并不直接具有法律上的约束力。
- 三方协议上的盖章则是各方对协议内容的认可和承诺，具有明确的法律效力。如果三方协议上的盖章与实习手册上的盖章不一致，可能会引发对协议有效性的质疑。
从实际执行的角度来看：
- 如果实习手册上的盖章单位与三方协议上的盖章单位不一致，可能会导致实习生在实习过程中的权益保障出现问题。例如，当实习生需要依据三方协议维护自己的权益时，可能会因为盖章单位的不一致而面临困难。
- 此外，这种不一致还可能导致学校在管理实习生、监督实习过程以及处理实习相关事宜时产生混乱。
从可能的风险和后果来看：
- 盖章不一致可能会被视为协议履行过程中的瑕疵，甚至可能导致协议被认定为无效。这将给实习生、实习单位和学校都带来不必要的法律风险和纠纷。
- 对于实习生而言，可能会因此失去原本依据三方协议应享有的权益和保障；对于实习单位而言，可能会面临因协议无效而需承担的法律责任；对于学校而言，则可能影响其对实习生的管理和监督。
因此，我建议你：
- 在签订三方协议前，务必确认实习手册上的盖章单位与三方协议上的盖章单位是否一致。
- 如果发现不一致的情况，应及时与实习单位、学校沟通并协商解决，以确保自己的权益得到保障。
- 在实习过程中，也要密切关注实习单位的变化情况，如有变动应及时与学校和实习单位沟通并更新相关手续和文件。
希望这些解释和建议能对你有所帮助。如果你还有其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。