单位在因纪委立案而不能办退休时，工资发放可能会受到影响，但并非一定停发。具体分析如下：

一. 工资发放可能受影响

• 法律依据：根据《行政机关公务员处分条例》第三十八条，被调查的公务员在违法违纪案件立案调查期间，不得办理退休手续。这一条款虽然直接关联的是退休手续的办理，但间接影响了工资发放的情境，因为退休手续的办理与工资发放、福利待遇等紧密相关。
• 实际情况：在实际操作中，如果公务员因纪委立案而不能办理退休，其工资发放可能会受到单位内部规定或相关政策的影响。一些单位可能会选择暂停发放工资，直至案件调查清楚；而另一些单位可能会继续发放基本工资，但暂停发放奖金、津贴等福利待遇。

二. 并非一定停发工资

• 法律未明确规定：《行政机关公务员处分条例》并未明确规定在立案调查期间必须停发工资。因此，具体是否停发工资，还需根据单位的具体规定和实际情况来判断。
• 单位自主权：单位在遵守相关法律法规的前提下，有一定的自主权来决定工资发放事宜。如果单位认为在立案调查期间继续发放工资符合规定且不会造成不良影响，那么可以选择继续发放工资。

我的观点：单位在因纪委立案而不能办退休时，是否发工资需根据单位的具体规定和实际情况来判断。如果单位有明确规定或相关政策支持，在立案调查期间可能会暂停发放工资或调整工资发放方式。但如果没有明确规定或相关政策支持，单位应继续按照原有规定发放工资。如有进一步需要，您可以继续咨询我。