针对您提出的问题“建筑工程税款已在工程款中扣除，能否再起诉要求施工方开发票”，以下是我的详细解答：

首先，我们需要明确的是，收取工程款并开具相应的工程款发票是承包方（施工方）在税法上的明确义务。这一义务并不因工程款中是否已扣除税款而改变。换句话说，无论工程款是否已经扣税，承包方在收到工程款后，都有义务向发包方（通常是建设单位或业主）开具相应数额的工程款发票。

接下来，我们分析您提到的具体情况。您提到“建筑工程税款已在工程款中扣除”，这通常意味着在支付工程款时，已经考虑了税款的扣除。然而，这并不免除承包方开具发票的义务。因为开具发票是承包方作为纳税人应尽的法定责任，也是发包方作为合同相对方应享有的合同权利。

现在，我们来看能否通过起诉要求施工方开具发票。根据最高法院的相关判例，如果承包方拒绝开具发票，发包方完全有权向法院提起诉讼，要求承包方履行开具发票的义务。法院在审理此类案件时，会依据税法规定和合同约定，判决承包方开具相应的工程款发票。

因此，结合您的情况，即使建筑工程税款已在工程款中扣除，您仍然有权向法院起诉要求施工方开具相应数额的工程款发票。这是您的合同权利，也是承包方应尽的法定义务。

最后，我建议您在起诉前，先尝试与施工方进行协商，看是否能够通过友好方式解决开具发票的问题。如果协商无果，再考虑通过法律途径维护自己的合法权益。