当股东会决议通过事项与公司章程约定不同时，一般应遵循公司章程的规定，因为公司章程具有更高的法律效力和对外公示的效力。下面我将从几个角度详细解释这一问题：

1. 公司章程的法律地位：

   • 公司章程是公司设立时必须制定的纲领性文件，具有法定性、稳定性和公开性。
   • 它规定了公司的基本架构、运营规则及根本性事项，相当于公司的“宪法”。
   • 对公司内部所有人员，包括股东、董事、监事等，均具有约束力。

2. 股东会决议的性质：

   • 股东会决议是股东会依职权对特定事项作出的决策结果，体现了股东的表决权。
   • 它具有临时性和特定性，针对具体问题形成，是公司运营中的“政令”。
   • 股东会决议的效力及于公司及全体股东，但其内容不得违反公司章程的规定。

3. 股东会决议与公司章程的关系：

   • 公司章程是股东会决议的基础和依据。股东会的召集程序、表决方式、职权范围等均受公司章程的约束。
   • 股东会只能在公司章程规定的职权范围内作出决议。如果股东会决议的内容与公司章程相冲突，那么该决议可能面临被撤销或确认无效的风险。

4. 处理冲突的原则：

   • 在股东会决议与公司章程发生冲突时，一般应以公司章程为准。
   • 因为公司章程不仅具有内部效力，还具有对外公示的效力，是公司对外交往的基本依据。
   • 如果股东认为股东会决议损害了其依据公司章程所享有的权益，可以依法提起诉讼，要求确认决议无效或撤销决议。

5. 实际案例的启示：

   • 在实际案例中，法院往往会根据公司章程的规定来判断股东会决议的合法性和有效性。
   • 如果股东会决议违反了公司章程的明确规定，法院很可能会支持股东提出的撤销或确认无效之诉。

综上所述，当股东会决议通过事项与公司章程约定不同时，应优先考虑公司章程的规定。如果股东对此有异议或争议，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。如果你在这方面有任何问题或需要进一步的法律咨询，可以直接向我提问。