针对您提出的“动物防疫法规定的运输车辆车主未备案的处罚”这一问题，我可以为您详细解答如下：
结论：根据《中华人民共和国动物防疫法》的相关规定，运输车辆车主若未进行备案，将面临由县级以上地方人民政府农业农村主管部门责令改正，并处以三千元以上三万元以下罚款的处罚。情节严重的，还可能被责令停业整顿，并处以三万元以上十万元以下罚款。
法律解释：
备案要求：
- 根据《中华人民共和国动物防疫法》第五十二条第三款，从事动物运输的单位、个人以及车辆，应当向所在地县级人民政府农业农村主管部门备案，并妥善保存行程路线和托运人提供的动物名称、检疫证明编号、数量等信息。
处罚规定：
- 若违反上述规定，即未经备案从事动物运输，根据《中华人民共和国动物防疫法》第九十八条第三项，将由县级以上地方人民政府农业农村主管部门责令改正，并处以三千元以上三万元以下罚款。
- 情节严重的，还将被责令停业整顿，并处以三万元以上十万元以下罚款。
实际案例：
- 以嘉祥县的一起案例为例，潘某某因驾驶未经备案的车辆从事动物运输，被嘉祥县农业农村局查处，并依据相关法律规定对其作出了责令改正并处罚款人民币3000元的行政处罚。
法律建议：
- 及时备案：从事动物运输的单位、个人及车辆应严格按照法律规定，及时向所在地县级人民政府农业农村主管部门进行备案。
- 合规运输：在运输过程中，应确保所有动物均经过检疫并持有有效的检疫证明，同时妥善保存相关运输信息。
- 了解法律：建议从事动物运输的相关人员深入了解《中华人民共和国动物防疫法》等相关法律法规，以确保自身行为的合法性。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您在动物防疫法或其他法律领域有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。