运输动物的车辆未经备案从事动物运输，处罚对象既可能是司机本人，也可能是车主本人，具体取决于实际情况和法律规定。以下从不同角度进行分析：
从行政责任的角度：
- 根据《中华人民共和国动物防疫法》的相关规定，从事动物运输的单位和个人，应当向所在地县级人民政府农业农村主管部门备案。如果运输动物的车辆未经备案，就违反了这一法律规定。
- 在这种情况下，如果司机是直接从事动物运输的人员，且未按照规定进行备案，那么司机本人可能会受到行政处罚，如罚款等。
- 如果车主明知车辆未经备案仍用于动物运输，或者车主是运输活动的组织者、管理者，那么车主也可能因未履行备案义务而受到行政处罚。
从民事责任的角度：
- 如果因运输动物的车辆未经备案导致动物疫情传播、动物死亡等损失，受损方可能会根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向责任方（可能是司机或车主）主张民事赔偿。
- 在这种情况下，责任方的确定将取决于具体的事实和证据，包括谁负责运输活动的组织、管理，谁未履行备案义务等。
从刑事责任的角度（虽然本案例中不太可能涉及，但为全面分析仍提及）：
- 如果运输动物的车辆未经备案且涉及严重违法行为，如非法运输国家保护动物、运输病死动物等，可能构成犯罪。
- 在这种情况下，犯罪主体（可能是司机或车主，或两者共同）将受到刑事处罚。
法律建议：
- 对于司机而言，应确保自己驾驶的车辆已按照规定进行备案，并了解并遵守相关动物防疫法律法规。
- 对于车主而言，应加强对运输活动的管理和监督，确保车辆和运输活动符合法律法规要求。
- 如果因未经备案的运输活动导致法律纠纷或损失，建议及时咨询专业律师，了解自身权利和义务，并采取相应的法律措施。
可能后果：
- 如果未经备案从事动物运输被查处，可能会面临行政处罚，如罚款、没收违法所得等。
- 如果因未经备案的运输活动导致动物疫情传播、动物死亡等损失，可能需要承担民事赔偿责任。
- 在极端情况下，如果涉及严重违法行为，可能构成犯罪并受到刑事处罚。
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