针对行政机关办公室面积超标的问题，处理方式主要依据超标的具体情况以及相关政策法规进行。以下是对此问题的详细解答：
一、超标面积的处理原则
轻微超标（如1-3平方米甚至更少）：
- 根据《中共中央办公厅国务院办公厅关于进一步做好办公用房清理整改工作的通知》（中办发〔2014〕64号），若领导干部职务未发生变动、未调换办公用房、也未进行过办公用房维修改造，且超标面积在30%以内（特别是面积微超在1平方米以内的），可暂不调整。待下次办公用房维修改造或领导干部职务变动调换办公用房时，再按照相关标准进行调整。
- 若立即整改确有困难，经机关事务管理部门审核同意后，可作备案处理，并明确整改期限，按期整改到位。
超标30%以上：
- 对于超标面积较大的情况（即超标30%以上），应立即合理制定整改方案，并按照相关标准整改到位。
二、超标办公室的后续管理
- 对于已作备案处理的超标办公室，在整改到位前，仍可继续安排领导干部使用，但应确保在规定的整改期限内完成整改。
- 通过调整房间、调整人员结构、多人合用等方式进行整改后，若仍有少量科级及以下房间办公室面积存在轻微超标（但机关办公室用房总面积不超标且单位人员未满编），可以预留核定面积调整给新进人员使用。
三、违规超标的责任追究
- 违反办公用房管理规定，超标准配备、使用办公用房的，对直接责任者和领导责任者将依据情节轻重给予相应的处分，如警告、严重警告、撤销党内职务等。
四、其他相关注意事项
- 办公室配备不与职级挂钩，而是按照所任领导职务对应的办公室使用面积标准执行。
- 对于原办公用房拆除后无新办公场所的问题，应采取整合调剂办公用房资源、租借等方式解决。
- 已经与所属党政机关改制脱钩的各类协会、学会等不得占用党政机关办公用房，已占用的应予以清理腾退或租用。
综上所述，处理行政机关办公室面积超标的问题需综合考虑超标面积的大小、整改的难易程度以及相关政策法规的要求，确保整改工作合规、有序进行。