双方约定按回款额的35%支付代理费，只要该约定是双方真实意思表示，且不违反法律、行政法规的强制性规定，即是合法的。针对这一问题，分析如下：

一. 合法性判断

1. 意思表示真实：根据《中华人民共和国民法典》第一百四十三条，民事法律行为有效的条件之一即意思表示真实。因此，双方关于代理费的约定，必须是双方真实、自愿的表达，不存在欺诈、胁迫等情形。
2. 不违反法律、行政法规：同样依据《中华人民共和国民法典》第一百四十三条，民事法律行为还需不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。关于代理费的支付比例，法律并未设定具体上限或下限，因此，按回款额的35%支付代理费，本身并不违反法律、行政法规的强制性规定。

二. 实际应用中的注意事项

• 明确约定：建议双方在合同中明确约定代理费的支付比例、支付时间、支付方式等，以避免后续产生争议。
• 合规性审查：在签订合同前，双方可对合同内容进行合规性审查，确保合同内容合法、有效。

综上所述，双方约定按回款额的35%支付代理费，在意思表示真实且不违反法律、行政法规的强制性规定的前提下，是合法的。如有进一步需要，您可以继续咨询我。