入职半年公司要求重新签入职协议，这一行为本身并不直接判定为合法或非法，其合法性取决于具体情况和协议内容。下面我从几个角度来分析这个问题：
补签劳动合同的情况：
- 如果公司之前未与你签订书面劳动合同，而入职半年后要求补签，根据《劳动合同法》的规定，用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。因此，在这种情况下，公司要求补签劳动合同以规避法律责任，但其之前的未签订行为已经违法，你可以主张相应的权益。
重新签订协议的内容：
- 如果公司要求重新签订的协议内容合理，且没有损害你的合法权益，比如只是更新了一些条款以适应公司政策或法律法规的变化，那么这样的要求通常是合法的。
- 但如果协议内容存在不公平、不合理的条款，如降低你的薪资待遇、增加你的工作负担等，那么你有权拒绝签订，并可以寻求法律援助保护自己的权益。
你的权益保护：
- 无论公司要求重新签订协议的原因是什么，你都应该仔细审查协议内容，确保自己的权益不受损害。
- 如果你对协议内容有任何疑问或不满，可以与公司进行沟通协商，或者咨询专业律师（比如我）以获取法律建议。
综上所述，入职半年公司要求重新签入职协议的合法性取决于具体情况和协议内容。你应该仔细审查协议内容，并根据自己的实际情况做出判断。如果有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。