事业单位工作人员工资不应该扣除工会经费。下面我将从相关法律法规和实际情况出发，详细解释这一结论。
法律解释
工会经费的来源：
- 根据《中国工会章程》和相关法律法规，工会经费主要由会员交纳的会费、企业事业单位等行政方面拨缴的经费以及政府或上级工会的补助等构成。
- 会员交纳的会费是由会员个人根据自身工资收入的一定比例自愿交纳的，而企业事业单位拨缴的经费则是根据相关法律法规的规定，按照一定比例从单位经费中拨给工会的。
工会经费与工资的关系：
- 工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，是劳动者的合法权益。
- 工会经费的拨缴和会员会费的交纳，并不构成对劳动者工资的扣除或减少。
事业单位工资发放规定：
- 事业单位工作人员的工资发放，应严格按照国家相关法律法规和政策规定执行。
- 在没有法律法规明确规定的情况下，不得随意扣除或减少事业单位工作人员的工资。
实际情况
- 在实际操作中，事业单位工作人员的工资发放通常不会扣除工会经费。工会经费的拨缴和会员会费的交纳，是独立于工资发放之外的另一套体系。
- 如果事业单位工作人员同时也是工会会员，并自愿交纳会费，那么会费应在其个人自愿的基础上交纳，而不应从工资中直接扣除。
综上所述，事业单位工作人员工资不应该扣除工会经费。如果在实际操作中遇到工资被扣除工会经费的情况，建议咨询单位财务部门或工会相关部门，了解具体情况并维护自己的合法权益。如果有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。