从工资中扣除工会经费是否合法，需根据具体情况来判断，核心在于员工是否自愿加入工会并同意代扣，以及企业是否按照法定程序操作。以下是对此问题的详细分析：
一、合法性条件
员工自愿加入工会：
- 员工必须自愿申请加入工会，成为工会会员后，才有义务缴纳会费。非会员无需缴纳工会会费。
- 企业在员工自愿成为工会会员后，按照规定标准代扣工会会费是合法的，但前提是必须得到员工的明确同意。
法定程序要求：
- 企业必须经过法定程序，如通过职工代表大会等民主程序，向员工明确说明工会会费的扣缴依据、标准和用途等相关事项。
- 保障员工的知情权是合法代扣的前提，企业应确保员工在充分了解的情况下自愿同意从工资中代扣会费。
合理标准：
- 工会会费的缴纳标准通常按照会员本人每月工资收入的特定比例计算（如0.5%），具体比例可能因地区或行业而有所不同，但应在合理范围内。
- 企业不得擅自提高收费标准或扩大收费范围，否则可能构成非法扣除。
二、非法扣除情形
员工未加入工会：
- 若员工未加入工会，企业擅自从工资中扣除工会费，属于违法行为。
未履行法定程序：
- 若企业未按照法定民主程序告知员工工会会费的扣缴事宜，或未得到员工的明确同意，同样构成非法扣除。
扣除标准不合理：
- 若企业扣除工会费的标准不符合规定，或擅自提高收费标准，也属于非法扣除行为。
三、法律后果与维权建议
法律后果：
- 非法扣除工会费可能引发劳动纠纷，导致企业面临法律责任，如返还非法扣除的工会费、支付赔偿金等。
- 长期非法扣除还可能影响企业的声誉和信誉，对企业的长期发展不利。
维权建议：
- 如果员工对工会费扣除存在疑问或争议，应先与企业的工会组织或人力资源部门进行沟通，了解扣缴的具体情况和依据。
- 若沟通无果，员工有权向劳动监察部门投诉或通过劳动仲裁等途径维护自身合法权益。在维权过程中，员工应保留好相关证据，如工资条、扣缴通知等，以便在需要时提供证明。
四、工会经费的正确缴纳与用途
- 缴纳方式：工会会员应按月向工会组织缴纳会费，缴纳比例为本人每月工资收入的0.5%；同时，企业应按每月全部职工工资总额的2%向工会拨缴经费。
- 经费用途：工会经费主要用于为职工服务和开展工会活动，如职工教育、文体活动、福利发放等。经费使用的具体办法由中华全国总工会制定，企业应确保工会经费的合理使用和透明管理。
总结来说，从工资中扣除工会经费的合法性取决于员工是否自愿加入工会并同意代扣，以及企业是否按照法定程序操作。企业和员工都应遵守相关法律法规，确保工会费的缴纳与使用合法合规。如果您对工会费扣除有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。