针对您提出的“夫妻分居后男方一直在还房贷，离婚时该如何分配”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，夫妻分居但并未离婚期间，婚姻关系依然存续。若房子是夫妻共同财产，即使房贷主要由男方独自偿还，这部分还款资金通常也被视为夫妻共同财产支出。
在离婚处理共同房产、房贷以及房产增值部分时，应遵循以下原则：
协商分配：
法院裁决：
- 若协商不成，法院会综合考虑买房时间、出资情况、双方对房子的贡献以及照顾子女、女方权益等因素来判定。
- 对于婚后共同购买的房屋，女方有权分得房产增值部分和共同还贷的份额。
- 若房产是男方婚前购买且登记在其名下，婚后共同还贷部分及对应的增值部分属于夫妻共同财产，离婚时女方有权要求分割。分居期间男方还贷部分，若能证明使用的是其个人财产，则这部分还贷及对应增值可能归男方；若无法证明，则按共同财产处理。
此外，还有几点特殊情况需要注意：
- 房产增值部分：在婚姻存续期间，房产可能因市场因素或其他原因而增值。这部分增值在离婚时也需要进行分配，通常依据双方对房产的贡献和婚姻关系存续对房产价值的影响来确定。
- 书面财产约定：如果夫妻双方之前有书面财产约定，明确婚姻关系存续期间所得财产归各自所有，并且银行贷款也明确约定为个人债务，由男方以个人财产偿还，那么还贷部分可认定为男方个人财产。
- 逾期记录责任：如果房贷偿还过程中存在逾期记录，对双方的信用都会产生影响。在离婚时，需要明确逾期责任归属，以便双方能够合理分担可能产生的信用损失。
综上所述，夫妻分居后男方一直在还房贷，离婚时的分配方式需根据具体情况而定。双方应首先尝试协商解决；协商不成时，可诉诸法院，由法院根据相关法律法规和实际情况作出公正裁决。