擅自离职按最低工资结算是不合法的。员工擅自离职时，用人单位仍需按照法律规定结算其工资，工资结算应遵循按实际工作天数计算、及时支付的原则。以下是对此问题的详细分析：

1. 工资结算原则：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》以及《工资支付暂行规定》，员工擅自离职时，用人单位应按照员工实际提供劳动的天数和劳动合同（或事实劳动关系）约定的工资标准来结算工资。例如，月工资为5000元的员工，若月计薪天数为21.75天，则日工资约为229.89元。员工实际工作10天，应得工资即为2298.9元。
   • 工资包括基本工资、绩效工资等正常出勤情况下应支付的劳动报酬，用人单位应在解除或终止劳动关系时一次性付清工资。

2. 经济损失赔偿：

   • 若员工擅自离职给用人单位造成经济损失，用人单位可依据相关证据和规章制度要求员工赔偿，但赔偿金额应从员工工资中合理扣除，且每月扣除部分不得超过员工当月工资的20%。扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。

3. 不得按最低工资结算：

   • 用人单位不得以擅自离职为由，将员工的工资结算标准降低为最低工资。工资结算应基于员工实际提供的劳动天数和劳动合同约定的工资标准，而非擅自离职这一行为本身。

4. 法律后果：

   • 如果用人单位擅自按最低工资结算员工工资，可能面临法律纠纷和劳动行政部门的处罚。员工有权向劳动行政部门投诉，要求用人单位按照法律规定支付工资。

综上所述，擅自离职按最低工资结算是不合法的。用人单位应按照员工实际提供的劳动天数和劳动合同约定的工资标准来结算工资，并遵守相关法律法规，确保程序合法、合规。如果员工擅自离职给用人单位造成经济损失，用人单位可依法要求员工赔偿，但不得随意降低员工的工资结算标准。