加计扣除的残疾人工资确实包括年终奖。以下是对这一结论的详细解释：
一、政策依据
主要政策：
- 根据《财政部 国家税务总局关于安置残疾人员就业有关企业所得税优惠政策问题的通知》（财税〔2009〕70号）第一条的规定，企业安置残疾人员的，在按照支付给残疾职工工资据实扣除的基础上，可以在计算应纳税所得额时按照支付给残疾职工工资的100%加计扣除。
工资薪金定义：
- 参照《国家税务总局关于企业工资薪金及职工福利费扣除问题的通知》（国税函〔2009〕3号）第一条对“工资薪金总额”的定义，它明确包括了基本工资、奖金、津贴、补贴、年终加薪等各项货币性收入。
综合解读：
- 虽然财税〔2009〕70号文中未直接提及年终奖，但结合国税函〔2009〕3号文对工资薪金总额的定义，我们可以合理推断出年终奖作为工资薪金的一部分，应被纳入加计扣除的范围。
二、实际操作
- 在实际操作中，企业支付给残疾员工的所有货币性收入，包括年终奖，通常都被视为工资的一部分。因此，年终奖理应也被纳入加计扣除的考虑范围。
三、建议与注意事项
地区差异与咨询：
- 尽管上述分析提供了明确的指导，但由于税务政策可能因地区或具体税务环境而异，建议企业在处理此类问题时，仍应咨询当地税务局或聘请专业的税务顾问进行指导，以确保合规性并正确享受税收优惠。
合规性重要性：
- 正确的税务处理对于企业的财务健康和合规运营至关重要。通过咨询专业人士，企业可以避免潜在的税务风险，并确保其税务策略与最新的税法规定保持一致。
记录与备查：
- 企业在享受加计扣除政策时，应详细记录支付给残疾员工的所有工资薪金，包括年终奖，以备税务部门核查。
综上所述，加计扣除的残疾人工资确实包括年终奖。企业在享受这一税收优惠政策时，应确保其对工资薪金的理解与税务法规保持一致，并咨询相关专业机构以获取准确指导，从而确保合规性并最大化税收优惠的效益。