代订酒店手续费是否可以抵扣，以及是否合法，取决于多个因素。以下是对这一问题的详细分析：
一、可以抵扣且合法的情况
企业正常经营相关的差旅住宿手续费：
- 如果企业员工因公务出差，通过正规渠道代订酒店并支付手续费，且取得了符合规定的增值税专用发票，那么该手续费与企业的生产经营活动直接相关，其进项税额是可以抵扣的，且合法。
企业正常经营相关的招待住宿手续费：
- 企业在经营过程中，因接待客户、合作伙伴等发生的住宿费用及手续费，如果代订并取得合法有效的增值税专用发票，且该招待行为有助于促进企业的业务发展和经营活动，那么手续费的进项税额同样可以抵扣，且合法。但需要注意的是，业务招待费的进项税额虽可抵扣，但在企业所得税汇算清缴时需进行纳税调整。
符合规定的员工培训住宿手续费：
- 企业为提高员工专业技能而组织的培训期间，如果发生住宿费用及手续费，且代订并取得合规的增值税专用发票，同时培训内容与企业的生产经营相关，那么手续费的进项税额也是可以抵扣的，且合法。
二、不可以抵扣或可能不合法的情况
个人消费性质的住宿手续费：
- 如果住宿费用及手续费用于个人旅游、度假、探亲访友等与企业生产经营无关的个人消费行为，那么其进项税额不能抵扣，且此种情况下的代订行为可能涉及违规或不合法。
取得非增值税专用发票或普通发票：
- 如果代订酒店手续费取得的是增值税普通发票或非正规发票，那么其进项税额不能抵扣。此外，使用非正规发票还可能涉及税务违法行为。
特定用途的住宿服务手续费：
- 如果住宿服务用于简易计税方法计税项目、免征增值税项目、集体福利或个人消费等，那么其手续费也不能抵扣进项税额。
特殊服务项目的手续费：
- 如旅行社或第三方平台开具的“代订机票费”等旅客运输服务的手续费，不属于增值税可抵扣项目。
三、注意事项与建议
- 确保发票合规：企业在代订酒店时，应确保所取得的发票为正规发票，内容真实、完整，符合增值税相关规定。
- 严格区分用途：企业应严格区分住宿费用及手续费的用途，确保其与企业生产经营活动直接相关。
- 咨询专业意见：如遇税务问题或疑虑，企业应及时咨询专业税务人员或律师，以确保企业税务安全。
综上所述，代订酒店手续费是否可以抵扣以及是否合法，需要根据具体情况综合判断。企业应严格按照税收法律法规的规定操作，确保抵扣的合法性和合规性。