当公司恶意拖欠工资时，劳动者确实有权申请赔偿金。以下是对此问题的详细解答：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第八十五条的规定，用人单位未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬；逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金。

2. 申请赔偿金的条件与流程：

   • 确认拖欠事实：劳动者需收集相关证据，如工资条、银行流水、工作记录等，以证明公司确实存在拖欠工资的行为。
   • 与公司协商：在采取法律手段之前，劳动者可以尝试与公司进行协商，要求支付拖欠的工资及可能的赔偿金。
   • 投诉至劳动行政部门：若协商无果，劳动者可以向当地的劳动行政部门投诉，并提交相关证据材料。劳动行政部门会对投诉进行调查核实，若确认公司存在拖欠工资的行为，会责令其限期支付。
   • 申请劳动仲裁或提起诉讼：若公司在限期内仍未支付，劳动者可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或直接向人民法院提起诉讼，要求公司支付拖欠的工资及赔偿金。
   • 执行判决：若仲裁裁决或法院判决支持劳动者的诉求，而公司仍不履行支付义务，劳动者可以向法院申请强制执行。

3. 注意事项：

   • 保留证据：劳动者在维权过程中应妥善保留所有相关证据，以便在需要时提供证明。
   • 了解时效：劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。因此，劳动者应及时行使自己的权利。
   • 寻求专业帮助：若劳动者对法律程序不熟悉或遇到困难，可以寻求律师的帮助。

综上所述，公司恶意拖欠工资时，劳动者不仅有权要求支付拖欠的工资，还可以依法申请赔偿金。在维权过程中，劳动者应保留好相关证据，了解仲裁时效，并必要时寻求专业法律帮助。