营运车在事故中被扣，确实有权主张停运费。这一费用属于因事故导致的间接损失，营运车辆的车主或经营者有权依法要求责任人进行赔偿。下面我将从法律依据、停运费的定义与性质、计算方式、主张条件与证据以及赔偿流程等多个角度为您详细分析：

一、法律依据

1. 《中华人民共和国民法典》：该法明确规定，侵害他人财产的，财产损失按照损失发生时的市场价格或者其他合理方式计算。营运车辆因事故等侵权行为导致停运，其停运期间的合理损失明确属于财产损失范畴。
2. 《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》：该解释第十二条明确规定，因道路交通事故造成依法从事货物运输、旅客运输等经营性活动的车辆无法从事相应经营活动所产生的合理停运损失，当事人请求侵权人赔偿的，人民法院应予支持。

二、停运费的定义与性质

停运费是交通事故导致的间接损失，指营运车辆因事故维修等合理期间内无法从事正常运营活动所遭受的收入减少。只要对方对事故发生存在过错，就应按责任比例分担此损失。

三、停运费的计算

1. 计算基础：停运费基于车辆实际的误工收入和停运时间来计算。误工费计算公式一般为：务工收入 × 误工天数。
2. 务工收入的确定：
   • 若车辆有固定的营运收入，根据停运时间直接计算损失金额。例如，如果车辆每天的平均营运收入为1000元，停运了10天，则停运费为1000元/天 × 10天 = 10000元。
   • 若车辆无固定营运收入，可参考相同或相近行业车辆的平均营运收入来计算。这可能需要通过市场调查或行业报告来获取相关数据。

四、主张停运费的条件与证据

1. 条件：车辆必须为合法的营运车辆，持有营运证等相关证件。这是主张停运费的前提条件，因为只有合法的营运车辆才能从事经营活动并产生停运损失。
2. 证据：提供营运合同、收入流水、停运时间证明等材料，以证明停运期间实际减少的收入情况。这些证据是主张停运费的关键，它们能够直接证明车辆因事故导致的停运时间和收入减少情况。

五、赔偿流程

1. 协商：首先向侵权人（即事故责任方）提出赔偿要求，并就停运损失的数额进行协商。如果双方能够达成一致意见，可以签订赔偿协议并履行。
2. 诉讼：若协商不成，可通过诉讼方式向人民法院提起诉讼，请求判决侵权人赔偿停运损失。法院会委托鉴定评估机构对停运损失进行评估，并根据评估结果作出判决。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据来支持自己的主张。

六、特殊情况处理

1. 保险公司赔付：需要注意的是，保险公司可能不赔偿停运损失（视为间接损失），赔偿责任可能落在肇事司机身上。因此，在申请赔偿时，您需要及时通知保险公司并保留好相关证据，以便必要时通过法律途径维护自身权益。
2. 责任比例分担：如果事故中双方都有责任，那么停运损失应按照责任比例进行分担。例如，如果对方承担70%的责任，您承担30%的责任，那么对方应赔偿您停运损失的70%。

总结与建议：

营运车在事故中被扣确实有权主张停运费，但需要满足一定的条件并提供充分的证据。在处理此类案件时，我建议您：

1. 及时收集证据：包括营运合同、收入流水、停运时间证明等材料，以便在主张赔偿时提供有力的支持。
2. 与侵权人协商：首先尝试与侵权人进行协商，看是否能够达成一致意见并签订赔偿协议。
3. 寻求法律帮助：如果协商不成或对方拒绝赔偿，您可以及时向我咨询并寻求法律帮助。我将根据您的具体情况提供专业的法律建议和诉讼服务。

希望以上分析能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。