有案底是否会被公司知道，主要取决于查询的合法性、必要性以及员工的个人披露情况。以下从多个角度为你详细分析：
一、普通公司难以直接查询案底
法律限制与保护：
- 犯罪记录属于个人隐私信息，受到法律的严格保护。根据《中华人民共和国民法典》第一千零三十三条，除法律另有规定或者权利人明确同意外，任何组织或者个人不得处理他人的私密信息。
- 普通公司通常没有直接查询个人犯罪记录的权限，司法机关等相关部门对犯罪记录有严格的管理和使用规定，不会随意向企业透露。
查询权限的界定：
- 对案底的正式查询通常由司法机关为办案需要或有关单位根据国家规定进行。查询案底的单位一般限于公安机关、国家安全机关、人民检察院和司法行政机关。
二、公司可能通过特定途径了解案底
员工主动告知：
- 公司在招聘或入职时可能会要求员工填写包含是否有犯罪记录等问题的背景信息表格。若员工如实填写，公司则会知晓。
- 员工故意隐瞒可能导致后续被解雇，因这违反了诚信原则，公司可能以欺诈为由解除劳动合同。
要求提供无犯罪记录证明：
- 在招聘过程中，公司可能会要求应聘者自行前往公安机关开具无犯罪记录证明。对于已经录用的员工，公司也可能通过内部规章制度要求提供此类证明。
委托第三方背景调查（需授权）：
- 部分高要求企业可能在获得员工授权后，委托专业背景调查公司通过合法渠道查询犯罪记录。这需符合相关规定和程序，不能擅自查询个人司法记录。
与政府部门、司法机构合作：
- 在与相关政府部门或司法机构的合作中，若涉及员工的司法信息，公司可能会从这些渠道获取到员工的案底情况。
三、特定行业或特殊岗位的查询要求
对于某些特定行业或岗位，法律法规明确要求从业人员必须具备无犯罪记录等条件，企业在招聘时会进行严格的背景审查：
金融行业：
- 如银行、证券、保险等领域的关键岗位，需具备良好的信誉和无违法犯罪记录，以确保金融安全。监管部门可能要求金融机构对拟录用人员进行包括犯罪记录查询在内的背景调查。
教育行业：
- 学校、教育机构在招聘教职工，特别是与未成年人密切接触的岗位时，会进行背景审查以保障未成年人的安全。根据相关规定，学校必须对拟聘用人员进行性侵违法犯罪信息查询。
交通运输行业：
- 如出租车、网约车司机等职业，一些地方要求驾驶员无犯罪记录，运输管理部门在核发从业资格证件时会进行审查。
公职岗位：
- 国家机关、事业单位招录公职人员时，会进行严格的政治审查，包括查询犯罪记录。涉及国家安全、商业机密保护等敏感岗位的企业也可能进行类似调查。
四、特殊情况下的查询与隐私保护
公开报道的情况：
- 如果个人因重大刑事案件或社会事件被公开报道，公司可能通过网络搜索等方式获取到这些信息。但即使如此，公司仍需遵守相关法律法规和隐私政策，不能随意使用这些信息。
尊重隐私权利：
- 保护个人隐私是一项重要权利。无论公司是否知晓员工的案底，都应尊重并遵守相关法律法规和隐私政策，确保信息的合法使用和保密。
五、法律建议
对于员工：
- 应如实填写个人信息，特别是在被要求提供无犯罪记录证明或填写个人背景信息时。故意隐瞒可能导致后续被解雇或承担法律责任。
- 如果公司非法查询或泄露应聘者的犯罪记录信息，应聘者有权依法维护自己的隐私权。
对于公司：
- 在查询员工案底时需严格遵守法律法规，尊重员工隐私权。在特定行业和岗位上，依据相关规定进行查询是合法的，但需确保查询的合法性和必要性。
- 建议公司咨询专业的法律顾问或律师，以确保操作合法合规，避免侵犯员工隐私权或引发法律纠纷。
综上所述，公司是否会知道员工的案底取决于多种因素，包括查询的合法性、必要性以及员工的个人披露情况。在大多数情况下，公司无法直接获取员工的犯罪记录等隐私信息；但在特定情况下，如员工授权或法律法规要求时，公司可能通过合法途径了解到这些信息。如果你有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。