公司把两个月工资合并计税是否合法，需分情况讨论：

1. 若公司因特殊原因（如财务结算周期、系统故障等）临时合并两个月工资计税，但全年总收入未因此多缴税，且符合税法规定：

   • 法律背景：根据《中华人民共和国个人所得税法》及相关规定，个人所得税的计算是基于个人全年的综合所得。如果公司因特殊原因临时合并两个月工资计税，但确保全年总收入的计算和纳税是准确的，没有导致员工多缴税，这种做法在税法上并不被直接禁止。
   • 建议：员工可以与公司沟通，要求公司提供详细的计税说明和全年纳税记录，以确保自己的权益不受损害。如果公司能够提供合理的解释和证明，且全年纳税无误，那么这种合并计税的方式是可以接受的。

2. 若公司故意合并两个月工资以规避税收或导致员工多缴税：

   • 法律背景：如果公司故意合并工资以降低单月工资额，从而规避较高税率的税收，或者因合并计税导致员工全年实际纳税额增加，这种做法就违反了税法的规定。税法要求个人所得税的计算应基于个人全年的真实收入，任何试图通过不正当手段规避税收的行为都是违法的。
   • 法律后果：公司可能面临税务机关的处罚，包括补缴税款、加收滞纳金和罚款等。同时，员工也有权要求公司纠正错误的计税方式，并赔偿因此造成的损失。
   • 建议：员工应首先与公司沟通，要求公司纠正错误的计税方式。如果公司拒绝改正，员工可以向当地税务机关举报，并寻求法律帮助以维护自己的权益。

额外提醒：

• 员工在收到工资时，应仔细核对工资条上的计税方式和纳税金额，确保自己的权益不受损害。
• 如果对公司计税方式有疑问或不满，应及时与公司沟通并寻求解决方案。
• 在处理此类问题时，员工可以保留相关证据（如工资条、银行流水等），以便在需要时提供证明。

总结：公司把两个月工资合并计税是否合法，取决于公司的动机和实际操作是否符合税法的规定。如果公司是出于特殊原因临时合并计税，且全年纳税无误，那么这种做法是可以接受的；但如果公司是故意合并工资以规避税收或导致员工多缴税，那么这种做法就是违法的。员工在遇到此类问题时，应仔细核对工资条和纳税记录，并及时与公司沟通或寻求法律帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。