结论：两个月工资分两个月发但扣税合在一起扣，这种做法在工资支付周期上可能不合法，而在税务处理上虽不直接违法但可能对员工不利。以下从工资支付和税务处理两个角度进行详细分析：
工资支付角度
法律规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”
- 《工资支付暂行规定》第七条也指出：“工资必须在用人单位与劳动者约定的日期支付。如遇节假日或休息日，则应提前在最近的工作日支付。工资至少每月支付一次，实行周、日、小时工资制的可按周、日、小时支付工资。”
分析说明：
- 如果用人单位与劳动者明确约定了工资支付周期为一个月，那么两个月工资一起发放（即使分两个月发放但实际支付周期延长）就可能违反了这一约定和劳动法的规定。因为这种做法可能导致劳动者无法按时获得劳动报酬，影响其基本生活需求。
- 在某些特殊情况下，如用人单位因生产经营困难暂时无法按时支付工资，或者与劳动者协商一致同意延迟支付等，两个月工资一起发放可能不构成违法。但这些情况需要有充分的理由和证据支持，并且不能成为常态化的做法。
法律后果：
- 如果用人单位经常性地将两个月工资一起发放，且没有合理的解释和证据支持，这种行为可能被视为拖欠工资。根据劳动法的规定，劳动者有权要求用人单位按照约定的时间支付工资，并可以向劳动行政部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
税务处理角度
税务规定：
- 从税务角度来看，个人所得税的计算是基于个人在一定时期内（通常是一个月）的收入来确定的。如果公司把两个月的工资合在一起发放，可能会导致个人所得税的税率档次提高，从而增加员工的税负。
分析说明：
- 虽然这种做法并不直接构成违法，但可能对员工造成不利影响。因为税率档次的提高意味着员工需要缴纳更多的个人所得税，这实际上减少了员工的实际收入。
- 员工有权要求用人单位按照约定的工资支付周期来发放工资，并按照实际收入来计算和缴纳个人所得税。如果用人单位坚持将两个月工资合在一起发放并扣税，员工可以向税务部门咨询或投诉。
建议：
- 作为劳动者，如果你发现用人单位存在两个月工资一起发放并扣税的情况，首先应当与用人单位进行沟通协商，要求其按照约定的工资支付周期来发放工资。
- 如果沟通无果，你可以向当地的劳动行政部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
- 同时，你也可以向税务部门咨询或投诉关于税务处理的问题，确保自己的合法权益不受侵害。
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