结论前置：

1. 一般情况下，事业单位自动离职人员的工龄不予计算，但社保缴费年限不受影响。
2. 特殊情况下，如能提供充分证据证明离职存在非本人主观意愿的合理因素，有可能争取对之前工龄的认可。

详细分析：

一、一般情况下的工龄计算

在事业单位中，工龄是员工福利待遇、退休金等权益的重要计算依据。根据原劳动人事部保险福利局《关于除名职工重新参加工作后工龄计算问题的复函》（劳人险函〔1984〕3号）等文件精神，以及一般的人事管理原则，自动离职人员连续工龄通常从重新参加工作之日起计算，自动离职前的工龄不计算为连续工龄。这是因为自动离职违反了单位的劳动纪律和管理规定，单位有权不计算其工龄。

举例说明：假设某员工在事业单位工作了5年后自动离职，之后又重新就业。在重新就业时，其工龄将从重新就业之日起计算，之前的5年工龄将不被计入。

二、特殊情况下的工龄计算

尽管一般情况下自动离职前的工龄不予计算，但也存在特殊情况。如果自动离职人员能提供充分证据证明其离职存在非本人主观意愿的合理因素，如因单位原因导致误解而离职，经过相关部门的调查核实和认定后，有可能争取对之前工龄的认可。然而，这种情况操作复杂，需经过严格审核程序。

举例说明：若某员工因单位未按时发放工资而自动离职，且能提供相关证据（如工资条、银行流水等）证明单位存在过错，那么该员工在申诉时有可能争取到对之前工龄的认可。

三、社保缴费年限与工龄的关系

无论是否自动离职，只要单位和个人已按规定缴纳了社会保险费，这部分缴费年限依然有效，并在符合养老金领取条件等情况下，可与后续缴费年限合并计算。这意味着，即使自动离职前的工龄不被计算，但已缴纳的社保费用不会因此作废。

举例说明：假设某员工在事业单位工作了5年后自动离职，期间单位和个人已按规定缴纳了社会保险费。那么，这5年的社保缴费年限依然有效，未来在计算养老金时，这5年将被计入总缴费年限。

四、操作建议

1. 了解当地政策：面对自动离职工龄计算的问题，工作人员应首先了解当地的具体政策规定，这可能因地区而异。
2. 提供充分证据：如有疑问或需要争取工龄认可，建议向当地的人力资源和社会保障部门咨询具体政策，并按照要求提供相关材料进行申诉和认定。
3. 寻求专业帮助：在处理此类问题时，也可考虑寻求专业法律顾问的帮助，以确保自身权益得到妥善维护。

总结与建议：

事业单位自动离职人员的工龄计算需综合考虑多种因素，包括离职前的连续工龄、社保缴纳情况、单位规定以及养老保险制度改革的时间点等。在一般情况下，自动离职前的工龄不予计算；但在特殊情况下，通过提供充分证据并经过严格审核程序，有可能争取对之前工龄的认可。同时，社保缴费年限不受自动离职影响，已缴纳的部分均予认可。因此，在处理此类问题时，建议工作人员充分了解当地政策，提供充分证据，并在必要时寻求专业帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。