当超市发现小偷并确认其偷窃行为后，应当依法、合理且有效地进行处理，以确保超市的合法权益，同时尊重他人的权利。以下是一个详细的处理流程：

一、确保安全与固定证据

1. 保障安全：首要任务是确保超市员工和顾客的人身安全，避免与小偷发生直接冲突，特别是当小偷有暴力反抗迹象时，应立即报警并保持安全距离。
2. 固定证据：利用超市的监控设备记录小偷的盗窃全过程，包括其外貌特征、行为举止以及所盗物品。同时，保留好被盗商品、可能的作案工具以及现场证人的联系方式，这些证据在后续的法律程序中至关重要。

二、与小偷沟通（在安全的前提下）

1. 表明身份与告知：在确保安全的情况下，超市工作人员应礼貌地表明身份，向小偷说明其盗窃行为已被发现，并告知其行为的严重性和可能的法律后果。
2. 询问与确认：询问小偷是否有误会或特殊原因，如购物疏忽等。若对方愿意承认错误，可考虑进一步处理，如要求赔偿或进行批评教育。

三、后续处理措施

1. 要求赔偿（可选）：对于初犯且情节较轻的小偷，超市可以要求其按照被盗物品的市场价格进行赔偿。赔偿金额应基于实际损失，并尽量与小偷协商一致。若小偷无法立即赔偿，超市可以保留追究其法律责任的权利。
2. 报警处理：若小偷拒绝承认、拒绝赔偿，或盗窃情节严重（如多次盗窃、盗窃价值较大等），超市应立即报警。在报警时，应向警方准确描述超市位置、小偷体貌特征、盗窃行为经过等信息，并安排专人看守小偷，确保其不逃脱，同时避免与其发生争执或冲突。

四、配合警方调查

1. 提供证据：警察到达现场后，超市应积极配合调查工作，提供所掌握的全部证据和相关信息，包括监控视频资料、被盗商品、目击证人陈述等。
2. 如实陈述：安排目击员工、保安等如实向警方陈述所见情况，协助警方查明案件事实。

五、法律后果与特殊情况处理

1. 法律后果：根据小偷的盗窃行为及其严重性，警方会依法对其进行处理。对于盗窃金额较小、尚未构成犯罪的情况，警方可能依据《中华人民共和国治安管理处罚法》对其进行拘留、罚款等行政处罚。若盗窃行为达到刑事犯罪标准，警方会将其移送检察机关审查起诉，根据《中华人民共和国刑法》进行刑事处罚。
2. 特殊情况处理：对于未成年人盗窃或主动认罪认罚、有自首情节的犯罪嫌疑人，司法实践中会综合考虑相关因素，从轻或者减轻处罚，并采取教育、感化、挽救的方针。

六、加强防范与记录报告

1. 加强防范：超市应加强内部防范措施，如定期检查货架、安装和维护监控设备、培训员工提高警惕性等，以减少盗窃事件的发生。
2. 详细记录与报告：对整个事件进行详细记录，包括时间、地点、小偷信息（如有）、盗窃物品、处理过程等，以备后续法律程序或内部管理需要。同时，及时将事件报告给上级领导或管理层，按照超市内部规定和流程进行处理。

综上所述，超市在处理小偷问题时，应遵循法律法规，确保处理的合法性、合理性和安全性。通过依法依规处理，不仅能够有效维护超市的合法权益和正常经营秩序，还能够确保小偷受到应有的惩罚，促进社会的公正与和谐。