公司调休是否合法，主要取决于调休的具体安排是否遵守了相关法律法规，是否与劳动者进行了充分协商，并是否保障了劳动者的合法权益。以下是对此问题的详细分析：
合法的调休情形
符合法律规定的加班与调休：
- 根据《劳动法》的规定，用人单位在保障劳动者身体健康的条件下，可延长工作时间，但每日不得超过三小时，每月不得超过三十六小时。若公司在法律允许的加班时长范围内，因生产经营需要安排员工加班，并在之后的工作日中安排同等时间的补休（即调休），这通常是合法的。
- 休息日安排工作也可进行调休，若不能安排补休，则需支付加班工资。例如，如果员工在周末加班，公司可以在后续的工作日安排调休，以弥补员工的休息时间。
有明确的规章制度且经过民主程序：
- 公司规章制度中应明确规定调休的条件、程序等。这些制度应与法律法规和劳动合同保持一致，且不得侵犯员工的合法权益。
- 该规章制度需通过职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定，并向劳动者公示或告知。例如，公司可以在员工手册中明确调休的申请流程、审批权限等，确保调休的透明度和公正性。
双方协商一致：
- 调休安排应事先与劳动者进行沟通协商，确保双方就调休时间、方式等达成一致意见。例如，公司可以与员工协商，在业务淡季或员工个人需要时安排调休，以平衡工作和生活。
不合法的调休情形
违反法定加班时间限制：
- 若公司长期让员工处于加班状态，累计加班时间远超法定上限，且未依法支付足额加班工资，这种调休安排是不合法的。例如，公司经常要求员工加班至深夜，且未提供调休或加班费，这违反了《劳动法》的相关规定。
未经协商一致的随意调休：
- 公司未与工会或员工协商，单方面频繁调休，打乱员工正常生活节奏和休息安排，这种做法是违法的。例如，公司突然通知员工在接下来的几周内每周都要调休一天，且未与员工进行任何沟通，这侵犯了员工的合法权益。
法定节假日调休不当：
- 法定节假日是国家规定的全民共同享有的休假日，公司应按国家规定放假，而非擅自安排调休。例如，公司在国庆节期间要求员工加班，并承诺后续安排调休，但调休时间却安排在了员工个人需要休息的时间，这违反了国家关于法定节假日的规定。
调休安排不符合劳动规章制度：
- 若公司未按照已公示的规章制度所规定的调休条件、程序进行调休，如拖延调休时间等，也是不合法的。例如，公司规章制度中规定员工加班后应在一个月内安排调休，但公司却拖延至数月后才安排，这违反了公司内部的规章制度。
长时间调休的合法性考量：
- 调休应基于员工实际加班的时间进行安排，不应超出员工实际加班时间。长时间调休需与员工协商一致，且不应影响用人单位的正常生产经营和员工的正常工作。例如，公司因业务调整需要安排员工长时间调休，但未与员工进行充分协商，且调休期间未支付员工基本工资，这侵犯了员工的合法权益。
劳动者的权益保护
- 若公司的调休安排侵犯了劳动者的合法权益，劳动者有权与公司进行沟通协商。在协商过程中，劳动者可以明确表达自己的诉求和理由，要求公司按照法律法规和劳动合同的规定进行调休安排。
- 协商不成的，劳动者可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的权益。劳动监察部门和劳动仲裁机构会依法对公司的调休安排进行审查，并作出相应的处理决定。
- 在某些情况下，劳动者甚至有权单方面解除劳动合同，并要求公司支付经济补偿金。例如，如果公司的调休安排严重违反了法律法规或劳动合同的规定，且给劳动者造成了重大损失或影响，劳动者可以依法解除劳动合同并要求公司承担相应的法律责任。
综上所述，公司调休的合法性是一个综合考量的问题，涉及法律法规的遵守、双方协商一致以及劳动者权益的保护等多个方面。只有在严格遵守相关法律法规、充分尊重劳动者权益的基础上，公司的调休安排才能被视为合法有效。如果您对公司的调休安排有疑问或不满，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。