结论前置：职务侵占退赔后，公司是否还能追究责任，这取决于多个因素，包括公司政策、侵占行为的严重性以及法律程序的进展。一般来说，即使退赔，公司仍有可能在法律层面追究责任，但具体是否追究会视情况而定。
一、公司角度的考量
可能不再追究的情况：
- 侵占金额小且情节轻微：如果职务侵占涉及的金额较小，对公司造成的实际损失有限，并且行为人迅速退还了全部款项，公司可能会出于内部稳定、避免负面影响扩大等考虑，选择不进一步追究。例如，某员工因一时疏忽或误解，侵占了公司少量财物，事后立即退还并诚恳道歉，公司可能会选择宽容处理。
- 员工价值与公司利益权衡：对于表现优秀、贡献突出的员工，若其职务侵占为偶发事件，并在事后积极补救，公司可能会综合评估员工的整体价值和此次事件的影响，决定不予追究。比如，一位长期为公司创造显著效益的员工，因个人原因一时糊涂侵占了公司财物，但事后积极退赔并表现出深刻的悔意，公司可能会考虑其过往贡献和未来价值，选择不追究其责任。
仍可能追究的情况：
- 公司制度严格：部分公司对职务侵占持零容忍态度，无论退赔情况如何，都会依据公司规定进行严肃处理，以示警戒。这类公司通常有完善的内部控制制度和严格的纪律要求，对任何违反规定的行为都会坚决查处。
- 声誉与风险考量：若职务侵占已对公司声誉造成损害或存在潜在法律风险，公司可能会坚持追究责任，以保护自身形象和避免未来风险。例如，职务侵占行为被媒体曝光或引发公众关注，公司为了维护自身声誉和品牌形象，可能会选择追究责任以彰显其公正和严肃态度。
二、法律层面的分析
刑事层面：
- 职务侵占罪的构成：根据《中华人民共和国刑法》第二百七十一条，利用职务便利非法占有本单位财物，数额较大即构成职务侵占罪。此罪行属于行为犯，一旦实施即构成犯罪，不论是否退还财物。因此，即使行为人退赔了侵占的款项，也不能完全免除其刑事责任。
- 量刑考量：虽然退还侵占款项及额外补贴可作为量刑时的从轻情节，但并不能完全免除刑事责任。司法机关会综合考虑侵占数额、犯罪手段、主观恶性及退赃主动性等因素来确定刑罚。例如，如果侵占数额巨大或手段恶劣，即使退赔也可能面临较重的刑罚。
民事层面：
- 财产权益保护：职务侵占侵犯了公司的财产权，公司有权要求侵占人返还财物并赔偿损失。即使已退还部分或全部款项，若公司认为损失未得到完全弥补，仍可通过民事诉讼追究民事责任。比如，公司因职务侵占行为遭受了间接损失（如声誉损害导致的业务流失），这些损失可能难以通过直接退赔来弥补，公司可以通过民事诉讼要求侵占人进行赔偿。
三、建议与对策
- 积极配合调查：面对职务侵占指控，行为人应积极配合相关部门的调查，主动说明情况，以减少误解和不利推测。这有助于争取从轻处理或减轻责任。
- 寻求法律帮助：尽早咨询并聘请专业律师，以便准确了解自己的法律处境，制定合适的应对策略。律师可以根据具体情况提供法律意见、协助谈判或进行辩护等。
综上所述，职务侵占行为即使全额退还并额外补贴，也并不能确保完全免除法律责任。公司会根据内部政策和实际情况决定是否追究，而法律层面则有着明确的定罪量刑标准。因此，行为人应充分认识到这一点，并采取积极措施应对可能的法律后果。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。