结论：公务员因两年考核不称职被辞退，一般情况下不需要支付赔偿金，但需根据具体情况判断是否符合法定辞退条件及程序。以下从法律背景、具体情形、例外情况三个角度详细分析：

一、法律背景：公务员辞退的法定条件

根据《中华人民共和国公务员法》第八十八条，公务员有下列情形之一的，予以辞退：

1. 在年度考核中，连续两年被确定为不称职的；
2. 不胜任现职工作，又不接受其他安排的；
3. 因所在机关调整、撤销、合并或者缩减编制员额需要调整工作，本人拒绝合理安排的；
4. 不履行公务员义务，不遵守法律和公务员纪律，经教育仍无转变，不适合继续在机关工作，又不宜给予开除处分的；
5. 旷工或者因公外出、请假期满无正当理由逾期不归连续超过十五天，或者一年内累计超过三十天的。

关键点：若公务员连续两年考核不称职，属于法定辞退情形之一，单位无需支付赔偿金，但需履行法定程序（如提前通知、听取陈述申辩等）。

二、具体情形：辞退程序需合法

即使符合“连续两年不称职”的条件，单位辞退公务员仍需满足以下程序要求：

1. 考核程序合法：考核结果需经法定程序作出（如民主测评、领导评议、结果公示等），且公务员有权对考核结果申请复核或申诉（《公务员法》第九十五条）。
2. 辞退前通知与申辩：单位应提前三十日书面通知公务员，并听取其陈述和申辩（《公务员法》第八十九条）。
3. 出具辞退证明：辞退决定应以书面形式送达公务员，并办理相关手续（《公务员法》第九十条）。

风险点：若单位未履行上述程序（如考核结果未公示、未听取申辩等），公务员可申请行政复议或提起行政诉讼，要求撤销辞退决定。此时，单位可能因程序违法承担不利后果，但无需支付“赔偿金”（行政赔偿需以违法行政行为为前提，且赔偿范围与劳动争议中的经济补偿不同）。

三、例外情况：可能涉及补偿的情形

1. 单位违法辞退：若单位以“连续两年不称职”为由辞退公务员，但实际考核程序违法（如考核标准不明确、结果未公示等），公务员可主张辞退决定无效，并要求恢复职务或赔偿损失（但此处的“赔偿”属于行政赔偿范畴，与劳动争议中的经济补偿不同）。
2. 公务员主动辞职：若公务员因单位未提供必要工作条件等原因主动辞职，可能符合《公务员法》第八十五条规定的“辞职补偿”情形（如未休年休假工资、应休未休探亲假报酬等），但与“考核不称职辞退”无关。
3. 特殊群体保护：对怀孕、产假、医疗期内的公务员，单位不得以考核不称职为由辞退（《公务员法》第八十九条）。若违法辞退，需承担行政责任，但无需支付“赔偿金”（可能涉及恢复职务或补发工资）。

法律建议

1. 对单位：辞退公务员需严格依据《公务员法》规定的条件和程序，保留考核记录、通知文书等证据，避免程序违法。
2. 对公务员：若认为考核结果或辞退决定违法，可在收到决定之日起三十日内申请复核，或六十日内提出申诉（《公务员法》第九十五条）；对申诉处理决定不服的，可向法院提起行政诉讼。

总结：公务员因两年考核不称职被辞退，通常无需支付赔偿金，但单位需确保考核程序和辞退程序合法。若程序违法，公务员可通过行政复议或诉讼维权，但赔偿范围与劳动争议中的经济补偿不同。如有具体案件细节，可进一步向我咨询。