公户发工资超过5000元，用人单位需依法履行代扣代缴个人所得税义务，并确保工资发放符合劳动法及税法规定。具体分析如下：

1. 个人所得税代扣代缴义务
   根据《中华人民共和国个人所得税法》第十一条，居民个人取得综合所得（包括工资薪金），按年计算个人所得税，由扣缴义务人（即用人单位）按月或按次预扣预缴税款。
   

• 税率适用：工资薪金所得适用超额累进税率，月收入超过5000元的部分需按对应税率计算应纳税额（如5000-8000元部分税率为3%，8000-17000元部分为10%，以此类推）。
  
• 专项附加扣除：若员工符合子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息、住房租金、赡养老人等专项附加扣除条件，可在税前扣除相应金额，降低应纳税所得额。
  
• 操作要求：用人单位需通过自然人电子税务局（扣缴端）申报工资薪金所得，并按时足额缴纳税款，否则可能面临税务行政处罚。

1. 工资发放的合法性要求
   除税务合规外，用人单位还需遵守《中华人民共和国劳动法》《中华人民共和国劳动合同法》等规定：
   

• 最低工资标准：确保工资发放不低于当地最低工资标准（如北京为2420元/月，上海为2690元/月）。
  
• 工资支付形式：工资应以货币形式按月支付，不得以实物或有价证券替代。
  
• 工资条提供：根据《工资支付暂行规定》，用人单位需向员工提供工资清单，明确工资构成（如基本工资、奖金、津贴等）及扣除项目（如社保、个税、考勤扣款等）。
  
• 禁止克扣或拖欠：除法定情形（如代扣个税、社保、法院判决等）外，用人单位不得克扣或无故拖欠员工工资。

1. 实务建议
   

• 完善工资制度：制定明确的工资结构及发放流程，确保符合劳动法及税法要求。
  
• 加强税务合规：定期组织财务或人事部门学习税法政策，避免因漏报、错报导致税务风险。
  
• 留存证据：保存工资发放记录、个税申报记录、员工签字确认的工资条等文件，以备税务检查或劳动争议时使用。
  
• 争议处理：若员工对工资发放或个税扣除有异议，用人单位需及时沟通解释，必要时可寻求法律途径解决。

若用人单位未依法履行上述义务，可能面临税务处罚（如补缴税款、滞纳金、罚款）或劳动争议（如员工主张补发工资、经济补偿等）。如有具体问题，可进一步向我咨询。