公司辞退员工并非按照最低工资进行赔偿，赔偿金额的确定需依据员工的工作年限、平均工资以及辞退的合法性来综合考量。以下是对这一问题的详细分析：

一、赔偿标准的基础

1. 经济补偿计算基数：经济补偿的计算基数是员工在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资，这一平均工资包括基本工资、奖金、津贴、补贴等所有货币性收入，而非仅指底薪或最低工资。

2. 工作年限与补偿月数：经济补偿的具体数额根据员工在公司的工作年限来确定。每满一年支付一个月工资的标准；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，则支付半个月工资的经济补偿。

二、不同辞退情形下的赔偿规定

1. 合法辞退且无需支付经济补偿：

   • 若员工存在严重违反公司规章制度、严重失职等法定过错情形，公司有权依法解除劳动合同，且无需向员工支付任何经济补偿或赔偿金。

2. 合法辞退但需支付经济补偿：

   • 在某些情况下，如经济性裁员、员工因健康原因不能胜任工作且经过调整仍无法适应等，公司虽可合法辞退员工，但需按照上述经济补偿标准支付相应费用。

3. 违法辞退：

   • 若公司无正当理由或未遵循法定程序即辞退员工，构成违法解除劳动合同。此时，公司需按照经济补偿标准的二倍向员工支付赔偿金。

三、具体赔偿计算示例

假设某员工在公司工作了三年，其月工资（包含基本工资、奖金等所有货币性收入）为6000元。若公司违法辞退该员工，赔偿计算如下：

• 经济补偿：6000元/月 × 3月 = 18000元（根据工作年限和平均工资计算）。
• 赔偿金：由于属于违法辞退，需支付经济补偿的二倍，即18000元 × 2 = 36000元。

四、特殊情况下的考虑

• 如果员工的实际工资低于当地最低工资标准，那么在计算经济补偿金时，虽然理论上可能会以最低工资标准为基数进行计算（但这并非直接按最低工资赔偿），但这种情况较为特殊，且需根据具体法律法规和当地政策来判断。然而，在大多数情况下，经济补偿的计算是基于员工的实际平均工资。

五、法律建议与权益保护

1. 对公司的建议：公司在辞退员工时，应确保辞退行为的合法性，并遵循法定程序。同时，应准确计算经济补偿或赔偿金，以避免可能的法律风险和经济损失。

2. 对员工的建议：员工应了解自己的权益和赔偿标准。在面临被辞退的情况时，应要求公司明确辞退原因，并准确计算应得的赔偿金额。如果公司拒绝支付或支付不足，员工可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。

综上所述，公司辞退员工的赔偿并非按照最低工资进行，而是依据员工的工作年限、平均工资以及辞退的合法性来确定。如果你或你身边的人遇到类似问题，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议。