星期六星期天请假扣双倍工资，这一做法是否违法，需分情况讨论：
若员工请假有合理事由且符合公司规章制度：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，员工享有休息休假的权利。在周末（星期六、星期天）本就是员工的休息日，若员工因特殊原因需要请假，且请假事由合理，同时符合公司的请假流程和规章制度，那么公司无权扣除员工双倍工资。
- 公司行为分析：如果公司在此情况下扣除双倍工资，这很可能构成对员工休息休假权利的侵犯，同时也违反了劳动法中关于工资支付的规定。员工有权向公司提出异议，并要求公司纠正这一不当行为。
若员工请假无合理事由或违反公司规章制度：
- 虽然周末是员工的休息日，但如果员工请假没有合理事由，或者违反了公司的请假制度和流程，公司有权根据规章制度对员工进行相应的处理。然而，这种处理应当是合理且合法的，不能随意扣除双倍工资。
- 公司行为限制：公司扣除工资的行为必须遵循法律法规的规定，不能超出合理范围。如果公司扣除的工资数额过高，或者没有明确的规章制度作为依据，那么这种行为同样可能构成违法。
关于加班与调休的特殊情况：
- 如果员工在周末被安排加班，且公司未按照法律规定支付加班费或安排调休，那么员工有权要求公司支付加班费或安排调休。在此情况下，如果员工因故不能加班而请假，公司不应扣除双倍工资作为加班费的替代。
- 加班费计算：若公司确实需要员工在周末加班，应按照法律规定支付不低于工资百分之二百的工资报酬。这是公司对员工加班的合法补偿，与请假扣工资是两个独立的问题。
法律建议：
- 对于员工而言，如果遇到公司无故扣除双倍工资的情况，应首先与公司进行沟通协商，要求公司说明扣除工资的理由和依据。
- 如果沟通无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉举报，或者通过劳动仲裁等法律途径维护自己的合法权益。
- 对于公司而言，应严格遵守劳动法律法规的规定，制定合理的请假制度和工资支付制度，确保员工的合法权益得到保障。
总结：星期六星期天请假扣双倍工资是否违法，取决于员工请假的事由是否合理、是否符合公司规章制度以及公司扣除工资的行为是否合法。如果员工认为公司的行为侵犯了自己的合法权益，可以通过法律途径进行维权。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。