公司星期六不上班扣双倍工资是违法的。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

一、法律角度

根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，工资是劳动者提供劳动后应得的报酬。公司无权因劳动者未在特定日期（如星期六）提供劳动而扣除其双倍工资。这种做法违反了劳动法中关于工资支付的基本原则，即工资应当与劳动者的实际劳动付出相对应。

二、合同角度

1. 劳动合同约定：如果劳动合同中明确规定了星期六为休息日，且未约定在此情况下扣除工资的条款，那么公司扣除双倍工资的行为显然违反了合同约定。
2. 合同未约定或约定不明：即使劳动合同中未明确规定星期六的休息或工资支付问题，公司也不能单方面决定扣除双倍工资。在这种情况下，应参照相关法律法规和行业惯例来处理。

三、实际操作与建议

1. 与公司沟通：首先，建议劳动者与公司进行沟通，了解公司扣除双倍工资的具体原因和依据。如果公司无法提供合理的解释或依据，劳动者可以进一步采取行动。
2. 向劳动监察部门投诉：如果与公司沟通无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉。劳动监察部门有权对公司进行调查，并要求其改正违法行为。
3. 申请劳动仲裁或提起诉讼：如果劳动监察部门的处理结果不能满足劳动者的诉求，劳动者还可以选择申请劳动仲裁或提起诉讼来维护自己的合法权益。

四、可能的法律后果

如果公司坚持扣除双倍工资，且该行为被认定为违法，那么公司可能面临以下法律后果：

1. 补发工资：公司需要补发被扣除的双倍工资给劳动者。
2. 支付赔偿金：根据违法行为的严重程度和劳动者的损失情况，公司可能还需要支付额外的赔偿金。
3. 行政处罚：劳动监察部门有权对公司进行行政处罚，如罚款、责令改正等。

总结与建议：公司星期六不上班扣双倍工资的行为是违法的。劳动者在遇到此类情况时，应首先与公司进行沟通，了解具体原因和依据。如果沟通无果，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁、提起诉讼来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。