在处理司法执行程序中，若申请执行人不同意以物抵债，我们需要根据具体情况和相关法律法规来采取相应措施。以下是对此问题的详细解答：
首先，我们要明确“以物抵债”的法律性质。它是指债务人通过将其所有的财产转让给债权人，以此来清偿债务。若申请执行人（即债权人）不接受这种方式，我们就需要探讨其他解决方案。
一、拍卖程序中的处理
第一次拍卖流拍：
- 如果第一次拍卖没有成功，且申请执行人或其他执行债权人拒绝接受或依法不能接受拍卖财产抵债，那么人民法院应在六十日内再行拍卖。
第二次拍卖及变卖：
- 对于动产，如果第二次拍卖仍然流拍，法院会询问申请执行人是否愿意接受以物抵债。若拒绝，法院将解除查封、扣押，并将动产退还被执行人。
- 对于不动产或其他财产权，第二次拍卖流拍后，同样会询问申请执行人。若其不接受，法院会在六十日内进行第三次拍卖。
第三次拍卖及后续处理：
- 如果第三次拍卖仍然流拍，且申请执行人仍不接受以物抵债，法院会在拍卖终结之日起七日内发出变卖公告。若公告期内无买受人，且申请执行人仍不接受抵债，法院将解除查封、冻结，将财产退还被执行人，并可能采取其他执行措施。
二、不经拍卖直接以物抵债的处理
- 如果执行过程中不经拍卖程序，而是直接拟以物抵债给申请人，但申请人不接受，法院不能强制要求其接受。此时，法院应继续采取其他执行措施，如查询、冻结、划拨被执行人的银行存款，查封、扣押、拍卖被执行人的其他财产，或对被执行人采取限制出境、纳入失信被执行人名单、罚款、拘留等强制执行措施。
三、抵债物存在瑕疵等情况的处理
- 如果申请人因抵债物存在质量瑕疵、权利负担等问题而不接受以物抵债，法院应对相关情况进行审查。若情况属实，法院不得强行推动以物抵债，并可要求被执行人解决瑕疵问题，或重新评估抵债物价值、调整抵债方案。若被执行人无法解决问题，法院需继续寻找其他可供执行的财产。
四、其他解决方案
协商与谈判：
- 与债务人进行深入沟通和协商，了解其不接受以物抵债的具体原因，尝试提出更灵活或更有吸引力的偿债方案，如分期付款、延期付款等。
第三方调解或仲裁：
- 若双方无法达成一致，可考虑寻求第三方的帮助进行调解或仲裁，以找到双方都能接受的解决方案。
法律诉讼：
- 若上述方法均无效，可通过法律途径解决争议。建议咨询专业律师，了解具体的法律程序和可能的结果。
强制执行的其他措施：
- 若已获得法院判决或裁定，且债务人仍拒绝履行债务，可申请法院采取其他强制措施，如查封、扣押、拍卖等。
替代性解决方案：
- 考虑债务重组、资产证券化等其他替代性解决方案，这些方案可能需要根据具体情况进行定制和设计。
综上所述，处理申请执行人不同意以物抵债的问题时，我们需要充分考虑申请人的意愿和实际情况，遵循相关法律法规，采取合理、合法的措施。同时，也建议双方在处理过程中保持冷静和理性，积极寻求共识，以实现债务的妥善解决。