化工厂对带烟火进厂的员工罚款两千是否合法，需分情况讨论：
若化工厂有明确的规章制度，且该制度合法合理：
- 制度合法性：根据《劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。化工厂作为易燃易爆场所，对烟火等可能引发安全事故的物品进行严格管理，并制定相应的处罚制度，是出于安全考虑的合理举措。若该制度在制定过程中经过了民主程序（如职工代表大会讨论、与工会或职工代表平等协商等），且内容不违反法律、行政法规及政策规定，不违背公序良俗，那么该制度就是合法的。
- 罚款合法性：在制度合法的前提下，化工厂依据该制度对带烟火进厂的员工进行罚款，若罚款金额在合理范围内（通常认为，罚款金额不应超过员工当月工资的20%，且扣除后的工资不得低于当地最低工资标准），且罚款程序合法（如事先告知员工、给予员工陈述申辩的机会等），那么这种罚款就是合法的。但两千元的罚款是否合理，需结合员工的工资水平、违规情节的严重程度以及化工厂的实际损失等因素综合判断。若两千元罚款明显过高，超出了合理范围，那么这种罚款就可能被认定为违法。
若化工厂没有明确的规章制度，或规章制度不合法：
- 无制度或制度不合法：如果化工厂没有制定关于禁止带烟火进厂及相应处罚的规章制度，或者制定的制度未经民主程序、内容违法或违背公序良俗，那么化工厂就不能依据该制度对员工进行罚款。
- 罚款违法性：在这种情况下，化工厂对员工罚款两千元就是违法的。员工有权拒绝支付该罚款，并可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
建议：
- 对于员工而言，如果认为化工厂的罚款不合理或违法，可以先与化工厂进行沟通协商，尝试解决问题。如果协商无果，可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，寻求法律援助。
- 对于化工厂而言，应当制定合法合理的规章制度，并确保制度的制定过程符合民主程序。在执行罚款等处罚措施时，应当遵循合法、合理、公正的原则，确保罚款金额在合理范围内，并给予员工充分的陈述申辩机会。
额外提醒：化工厂作为特殊行业，对安全的要求极高。员工应当严格遵守化工厂的安全规定，不得携带烟火等可能引发安全事故的物品进入厂区。这不仅是为了保护自己的生命安全，也是为了保护其他员工和化工厂的财产安全。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。