结论：有证卖假烟在特定情况下仍可能构成非法经营罪，但也可能涉及销售伪劣产品罪或销售假冒注册商标的商品罪等其他罪名，具体需结合案件事实和法律规定综合判断。
一、非法经营罪的适用性分析
法律依据与构成要件：
- 根据《中华人民共和国刑法》第二百二十五条，未经许可经营法律、行政法规规定的专营、专卖物品，扰乱市场秩序且情节严重的，构成非法经营罪。烟草属于国家专卖品，经营烟草制品必须取得烟草专卖零售许可证等相关许可。
有证卖假烟的违法性：
- 即便持有烟草专卖零售许可证，若销售的是假冒伪劣烟草，这一行为本身就违反了国家对烟草质量的管理规定。同时，如果销售行为超出了许可证规定的范围（如批发而非零售）、跨地域经营或销售非法渠道购进的烟草，也可能构成非法经营。
情节严重的认定：
- 通常结合非法经营的数额、违法所得数额及社会影响等因素综合判断。个人非法经营数额达五万元以上或违法所得一万元以上，单位则分别为五十万元和十万元以上，一般可认定为情节严重。
二、其他可能涉及的罪名
销售伪劣产品罪：
- 如果销售的假冒伪劣烟草销售金额达到一定标准，还可能构成销售伪劣产品罪。这一罪名主要关注的是产品的质量，而非经营许可问题。
销售假冒注册商标的商品罪：
- 若销售的假冒伪劣烟草使用了他人注册的商标，且销售金额较大，则可能同时构成销售假冒注册商标的商品罪。这一罪名侧重于保护商标权人的合法权益。
三、司法实践与观点分歧
- 在司法实践中，对于有证卖假烟的行为，不同地区的办案机关可能存在不同的理解和解释，导致定罪处罚的差异。有的地区可能更倾向于以非法经营罪处理，尤其是当销售行为超出许可证范围或扰乱市场秩序时；而有的地区则可能更关注产品的质量或商标问题，从而以销售伪劣产品罪或销售假冒注册商标的商品罪论处。
四、综合判断与建议
综合判断：
- 具体案件的定罪需综合考虑行为人的主观故意、客观行为、犯罪数额、社会影响以及法律法规和司法解释的规定。如果行为人明知是假冒伪劣烟草仍进行销售，且数额较大，同时触犯了多个罪名，应根据想象竞合的原则择一重罪论处。
建议：
- 对于持有烟草专卖零售许可证的经营者，应严格遵守烟草专卖相关法律法规，确保在许可证规定的范围内合法经营，不销售假冒伪劣烟草。
- 如果面临相关法律问题或纠纷，应及时咨询专业律师，了解自身权利和义务，以便更好地维护自己的合法权益。
综上所述，有证卖假烟在特定情况下仍可能构成非法经营罪，但也可能涉及其他罪名。在具体案件中，应根据相关法律法规、司法解释以及案件的具体情况来综合判断，并依法作出公正合理的裁决。如果你有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。