员工自动离职时，上个月工资的计算需根据具体情况确定，核心原则是：工资应按实际出勤天数计算，但用人单位可扣除因员工自动离职造成的直接经济损失，且扣除部分不得超过当月工资的20%，同时扣除后工资不得低于当地最低工资标准。以下是具体分析：

1. 工资计算的基本原则

根据《工资支付暂行规定》第七条，工资应按劳动者实际出勤天数计算。若员工自动离职（即未提前30日书面通知用人单位解除劳动合同），用人单位仍需支付其上月实际工作期间的工资，计算方式为：
上月工资 = 月工资标准 ÷ 当月应出勤天数 × 实际出勤天数
例如，员工月工资为6000元，当月应出勤22天，实际出勤15天，则应发工资为：6000 ÷ 22 × 15 ≈ 4090.91元。

2. 用人单位可扣除的费用

若员工自动离职给用人单位造成直接经济损失（如未交接工作导致项目延误、客户流失等），用人单位可依据《工资支付暂行规定》第十六条，要求员工赔偿，并从工资中扣除。但需满足以下条件：

• 损失需直接关联：如员工未交接工作导致用人单位额外支付加班费、招聘替代人员的费用等；
  
• 扣除比例限制：每月扣除部分不得超过员工当月工资的20%；
  
• 最低工资保障：扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准（如北京为2420元/月）。
  

示例：若员工上月工资为4090.91元，用人单位因未交接工作产生直接损失1000元，则最多可扣除：4090.91 × 20% ≈ 818.18元，实际发放工资为：4090.91 - 818.18 = 3272.73元（仍高于北京最低工资标准）。

3. 用人单位不得扣除的费用

以下费用不得从工资中扣除：

• 未提前通知的“违约金”：根据《劳动合同法》第二十五条，除专项培训服务期、竞业限制外，用人单位不得与劳动者约定由劳动者承担违约金；
  
• 与离职无关的费用：如员工在职期间的个人借款、罚款（除非符合法定情形）等。

4. 实务建议

• 对员工：若用人单位拒绝支付工资或不合理扣款，可向当地劳动监察大队投诉，或申请劳动仲裁（需在离职后1年内提出）；
  
• 对用人单位：应保留员工未交接工作导致损失的证据（如书面通知、第三方评估报告等），并在工资条中明确扣除项目及金额，避免纠纷。

总结：员工自动离职时，上月工资按实际出勤天数计算，用人单位可扣除直接经济损失（需符合比例和最低工资限制），但不得扣除违约金或无关费用。若双方对工资计算有争议，建议通过劳动仲裁解决。如有进一步问题，可直接向我咨询。