关于公司业绩不达标或业绩未完成而对员工进行罚款的合法性问题，这确实是一个涉及劳动法、劳动合同法以及行政处罚法等多个法律领域的复杂议题。以下是我为您提供的详细分析：
一、一般情况下的不合法性
法律依据缺失：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位并无直接对员工进行罚款的法定权利。工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，用人单位需按合同约定和国家规定及时足额支付，不得克扣或无故拖欠。
- 罚款作为对财产权的剥夺，其执行主体应为具备行政处罚权的行政机关，而公司并不具备这样的权力。
罚款的合理性问题：
- 即便公司有内部规章制度，但如果罚款标准不明确、不合理，或者影响了员工的最低工资保障，那么该罚款行为同样可能被视为不合法。
劳动合同变更的合法性：
- 劳动合同的变更需双方协商一致并采用书面形式。公司单方面设定罚款规定，相当于变更劳动合同中的劳动报酬条款，未经员工同意则不具有法律效力。
二、特殊情况下的合法性
尽管在大多数情况下，公司因员工业绩不达标或未完成而进行罚款是不合法的，但也存在一些特殊情况，使得罚款行为可能被视为合法：
劳动合同中的明确约定：
- 如果公司与员工在劳动合同中明确约定了业绩目标与绩效奖金的挂钩机制，且该约定不违反法律法规的强制性规定，双方真实意思表示一致，那么公司可根据约定扣减绩效奖金。但需要注意的是，绩效奖金作为额外奖励，其发放与扣减均基于员工的工作表现和业绩情况，不构成基本工资的一部分。
公司规章制度的合法性：
- 如果公司依法制定的规章制度中明确规定了业绩未完成的扣罚措施，并且该规章制度在制定过程中经过了职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定，并已向劳动者公示或告知，那么这种情况下的罚款规定可能被认定有效。但同样，罚款的合理性仍需接受审查，如罚款金额不能过高，不能影响员工基本生活等。
三、员工权益保护与维权途径
- 如果员工认为公司的罚款行为侵犯了自己的合法权益，首先可以尝试与公司协商解决，要求纠正违法行为并恢复被克扣的工资。
- 如果协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉，寻求调查处理。
- 若以上途径均无法解决问题，员工还可以向劳动仲裁机构申请仲裁，或向人民法院提起诉讼，通过法律手段来维护自己的权益。
总结与建议：
公司业绩不达标或未完成而对员工进行罚款的合法性需根据具体情况判断。公司应确保罚款行为的合法性与合理性，避免侵犯员工的合法权益。同时，员工也应了解自己的权益，并在面对不合法罚款时积极采取措施保护自身利益。如果公司确实需要采取某种形式的奖惩措施来激励员工，建议通过合法、合理的方式，如设立绩效奖金、提供培训机会等，来达到这一目的。