关于您提到的一调二调是设施农业用地，三调变为基本农田的情况，是否合法，这需要根据具体的法律规定和实际情况来判断。以下是我的详细分析：

首先，明确结论：

• 土地性质的变更是否合法，主要取决于变更过程是否遵循了相关的法律法规和程序。

接下来，分析具体情况：

1. 土地性质变更的法律依据：

   • 我国土地性质的变更需要遵循《中华人民共和国土地管理法》等相关法律法规。
   • 土地性质的变更通常需要经过相关部门的审批和备案，确保变更的合法性和合规性。

2. 一调二调与三调的区别：

   • 一调、二调、三调通常指的是不同时间点的土地调查或规划。
   • 这些调查或规划可能会根据当时的政策、法律和社会经济发展情况进行调整。

3. 设施农业用地与基本农田的性质：

   • 设施农业用地通常用于农业设施建设，如温室、大棚等，其土地性质和使用目的有明确的法律规定。
   • 基本农田是国家为了保护粮食安全而划定的特定区域，其土地性质和使用有严格的限制。

4. 变更的合法性分析：

   • 如果土地从设施农业用地变更为基本农田，这一变更是否合法，需要看变更过程是否经过了相关部门的审批，是否符合当时的土地政策和法律。
   • 如果变更未经审批或违反了相关法律法规，那么这一变更就是不合法的。

5. 建议与行动：

   • 如果您对这一变更存在疑问或争议，建议咨询当地土地管理部门或相关部门，了解变更的具体情况和法律依据。
   • 如果发现变更存在违法行为，您可以依法向相关部门举报或寻求法律援助。

综上所述，土地性质的变更是否合法，需要综合考虑多个因素，包括法律法规、政策规定、变更程序等。如果您对具体情况有疑问，建议进一步咨询相关部门或专业律师以获取更准确的法律意见。