学校食堂使用转基因菜籽油，如果未按照规定进行标示，是有可能被追责的。

首先，从法律角度来看，《中华人民共和国食品安全法》对食品的安全标准和标示有着明确的规定。其中，第六十九条要求食品经营者应当按照规定对经营的食品进行标示，包括食品的成分、转基因成分等。如果学校食堂使用了转基因菜籽油，但未按照规定进行显著标示，就违反了这一法律规定。

其次，违反《食品安全法》的相关规定，市场监督管理部门有权依法进行处罚。根据该法第一百二十五条第一款的规定，对于未按规定进行标示的行为，可以处以没收违法所得、没收违法经营的食品、罚款等行政处罚。就像沧州渤海新区黄骅市市场监督管理局对某幼儿园食堂使用未标示转基因大豆油的行为作出的处罚一样，学校食堂也可能面临类似的法律后果。

因此，学校食堂在使用转基因菜籽油时，必须严格按照法律规定进行标示，以避免可能的法律风险和责任。如果学校食堂确实使用了转基因菜籽油，并且未按照规定进行标示，那么市场监督管理部门是有权进行追责的，包括没收食品、罚款等处罚措施。

综上所述，学校食堂在使用转基因菜籽油时，应当谨慎对待，确保遵守相关法律法规，以免引发不必要的法律纠纷和损失。如果有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。