离职后档案仍留在原公司确实可能产生一系列影响，因此不建议长期将档案存放在原单位。以下从不同角度为你详细分析：
一、档案长期存放在原单位的可能影响
管理责任与风险：
- 原单位对离职员工档案无长期保管义务，长期留存可能增加管理成本与法律风险。若因保管不善导致档案丢失或损坏，原单位需承担相应责任，但这并不意味着你可以完全放心，因为一旦出现问题，补办档案等后续处理会非常繁琐。
影响个人权益：
- 档案滞留可能导致社保转移、新单位入职审查等流程受阻。例如，新单位可能要求调阅完整人事档案以完成入职手续，若档案仍在原单位，可能影响你的入职进程。
- 档案是核实社保信息、办理退休手续及职称评定的重要依据。长期搁置可能导致相关事务无法顺利进行，影响你的长远利益。
政策合规性：
- 根据《企业职工档案管理工作规定》，离职人员档案应及时转递至其户籍所在地或新就业单位的档案管理机构。长期滞留原单位可能违反相关规定，虽然这一规定更多是对原单位的约束，但作为员工，你也应关注自己的档案合规性。
二、档案的正确处理方式
及时转移档案：
- 未就业者：将档案转至户籍所在地的公共就业和人才服务机构（如人才市场）。这是最常见的处理方式，可以确保档案得到妥善保管，并在你需要时方便调取。
- 已就业者：由新单位人事部门开具调档函，将档案转至新单位或其指定的档案管理机构。这是入职新单位时的常规流程，务必按照新单位的要求及时办理。
确认档案状态：
- 通过原单位人事部门查询档案当前位置，确保未被遗失或错误归档。这是非常重要的步骤，可以避免档案丢失或损坏后无法及时补办的情况。
办理相关手续：
- 配合原单位完成档案转出所需的材料准备（如身份证复印件、调档函等），并关注转移进度。这是确保档案顺利转移的关键步骤，务必按照原单位的要求及时提供所需材料。
三、特殊情况说明
- 短期暂存：若因特殊原因（如新单位尚未确定）需临时存放，应与原单位协商明确暂存期限，避免长期搁置。但这种情况应尽量避免，因为长期暂存可能带来不必要的风险和麻烦。
- 档案补办：若发现档案缺失或损毁，需尽快联系原单位或学校补办相关材料，以免影响后续使用。档案补办是一个复杂且耗时的过程，因此务必及时发现并处理问题。
四、法律依据
根据《中华人民共和国劳动合同法》第五十条，用人单位在解除或终止劳动合同时，有义务在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。这意味着，原单位必须依法履行档案转移的职责，而你也应关注自己的档案转移情况，确保权益得到保障。
总结与建议：离职后，你应主动关注自己的档案去向，及时与原单位沟通并办理档案转移手续。若档案已滞留原单位多年，建议尽快联系原单位或相关档案管理机构查询档案状态，并按照上述建议处理档案事宜。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。