“上六休一”工作制度是否合法，取决于具体的工作时间安排、加班补偿情况以及是否满足特殊工时制度的审批要求。以下是对此问题的详细分析：
合法情况分析
符合标准工时制：
- 根据《中华人民共和国劳动法》，我国实行劳动者每日工作时间不超过8小时、平均每周工作时间不超过44小时的工时制度。若“上六休一”的工作安排下，劳动者每日工作时间不超过8小时，且每周总工作时间不超过44小时（例如，每天工作7小时，每周共42小时），则该工作安排符合法律规定，为合法安排。
经过特殊程序批准：
- 对于因生产特点不能实行常规工时制度的企业，经劳动行政部门批准，可以实行其他工作和休息办法。特殊行业或企业（如连续生产的化工、电力等行业）因其生产经营的特殊性，可能无法遵循常规的工时制度。这些企业在获得劳动行政部门批准后，实行的“上六休一”工作制度，只要保障了劳动者的合法权益，即为合法。
综合计算工时工作制：
- 以周、月、季、年为周期综合计算工作时间，只要综合计算周期内的总实际工作时间不超过法定标准，即视为合法。例如，在某些季节性生产的企业中，可能存在一段时间内工作繁忙，需要“上六休一”，但只要在一个完整的计算周期内，总工作时间未超过法定标准，且保证了劳动者的休息权利，这样的安排就是合法的。
不定时工作制：
- 无固定工作时间限制，适用于特定职业群体，如高级管理人员、外勤人员等。对于这些职业群体，由于工作性质特殊，无法固定衡量工作时间，因此不存在“上六休一”是否违法的问题。但企业应合理确定劳动者的劳动定额或考核标准，并确保劳动者的休息休假权利不受侵害。
违法情况分析
- 超出法定工作时间且无补偿或未经批准：
- 若“上六休一”导致劳动者每周工作时间超过44小时，且用人单位未按照法律规定安排补休、支付加班工资，或未经劳动行政部门批准，则违反劳动法规定。例如，若某单位实行“上六休一”，员工每天工作8小时，则每周工作时间达到48小时，超出了法定的44小时。此时，若单位既不安排补休也不支付加班工资，且未经劳动行政部门批准，该工作安排即构成违法。
加班补偿与劳动者权益保护
加班补偿：
- 如果“上六休一”导致工作时间超出标准工时制，则属于加班。用人单位应依法支付加班费，具体为：延长工作时间支付不低于工资的150%的工资报酬；休息日工作且不能安排补休的，支付不低于工资的200%的工资报酬。
劳动者权益保护：
- 劳动者若认为工作时间超标或未获应有报酬和休息，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。在签订劳动合同时，劳动者也应仔细审查合同中关于工作时间和休息安排的条款，确保自己的合法权益不受侵害。
总结与建议
“上六休一”工作制度并非一概而论地合法或非法，其合法性取决于多个因素。用人单位在制定工作制度和安排工作时间时，应充分考虑劳动者的休息权益，确保符合相关法律法规的规定。同时，劳动者也应了解自己的合法权益，并在必要时依法维权。如果你对具体的工作安排或劳动合同条款有疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。