“上九休一”工作制度是否合法，取决于具体的工时安排、加班补偿情况以及是否满足特殊工时制度的审批要求。以下是对此问题的详细分析：

1. 标准工时制下的合法性：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》，我国实行劳动者每日工作时间不超过8小时、平均每周工作时间不超过44小时的工时制度。若“上九休一”的工作制度下，劳动者每日工作时间未超过8小时，且一周总工时未超过44小时，那么该制度在标准工时制下是合法的。但这种情况较为罕见，因为通常“上九休一”会意味着较长的工作日和较少的休息日，很容易超出标准工时。

2. 特殊工时制度下的合法性：

   • 对于不能实行标准工时制度的企业，经劳动行政部门批准，可以实行不定时工作制或综合计算工时工作制。
   • 不定时工作制：无固定工作时间限制，主要适用于特定职业群体，如高级管理人员、外勤人员等。在这种制度下，“上九休一”并不构成违法，因为工作时间本身就不固定。
   • 综合计算工时工作制：以周、月、季、年为周期综合计算工作时间。只要综合计算周期内的总实际工作时间不超过法定标准（即平均每周不超过44小时），那么“上九休一”的工作制度在综合计算工时工作制下也是合法的。但同样，这需要企业事先获得劳动行政部门的批准。

3. 加班补偿的考量：

   • 如果“上九休一”导致劳动者的工作时间超出了标准工时制或特殊工时制度下的法定工作时间，那么超出部分应视为加班。
   • 用人单位应依法支付加班费。具体来说，延长工作时间应支付不低于工资的150%的工资报酬；休息日工作且不能安排补休的，应支付不低于工资的200%的工资报酬。若“上九休一”中包含了法定节假日的工作，则还需按照不低于工资的300%支付工资报酬。

4. 劳动者权益保护与维权途径：

   • 劳动者有权享受法定的休息时间和加班补偿。若用人单位未遵守相关法律法规，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
   • 在投诉或申请仲裁时，劳动者应提供相关证据，如工作记录、工资单等，以证明用人单位存在违法行为。

总结与建议： “上九休一”工作制度的合法性并非一概而论，而是取决于具体的工时安排、加班补偿情况以及是否满足特殊工时制度的审批要求。用人单位在制定工作制度时，应严格遵守相关法律法规，确保劳动者的合法权益不受损害。同时，劳动者也应了解自己的权益，并在必要时采取适当的维权措施。若你对“上九休一”工作制度的具体合法性有疑问，或认为自己的权益受到了侵害，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。