公司注销时，劳动关系原则上必然终止，但需结合具体情况分析。以下从不同角度详细阐述：

1. 法律层面的直接规定

根据《劳动合同法》第四十四条第五项，用人单位被依法宣告破产、被吊销营业执照、责令关闭、撤销或用人单位决定提前解散的，劳动合同终止。公司注销属于“用人单位决定提前解散”的情形，因此劳动关系自公司完成注销登记时终止。
关键点：注销是公司法人资格消灭的法定程序，劳动关系作为公司与劳动者之间的法律关系，必然随公司主体资格的消灭而终止。

2. 注销程序中的劳动关系处理

公司注销前需完成清算程序，而清算期间劳动关系仍存续，但需分阶段处理：

• 清算阶段：公司需成立清算组，通知债权人并公告。此时劳动关系未终止，但公司可能因经营困难与劳动者协商解除合同或支付经济补偿。
  
• 注销登记完成：公司法人资格消灭，劳动关系自动终止。若清算组未依法处理劳动关系（如未支付工资、经济补偿），劳动者可向清算组成员主张权利（《公司法》第一百八十三条、第一百八十九条）。
  示例：若公司未支付员工最后一个月工资即完成注销，员工可要求清算组成员（如股东）在清算财产范围内承担赔偿责任。

3. 特殊情形：注销后发现未了结的劳动关系

若公司注销后才发现存在未处理的劳动关系（如未支付加班费、未缴纳社保），劳动者仍可维权：

• 向股东主张权利：若公司注销时未依法清算，股东可能需对公司债务承担连带责任（《公司法司法解释二》第二十条）。
  
• 向实际控制人主张权利：若公司实际控制人操纵注销程序逃避债务，劳动者可追究其法律责任。
  关键点：注销不意味着劳动关系纠纷的绝对消灭，关键看公司是否依法履行清算义务。

4. 实务建议

• 对公司：注销前应全面梳理劳动关系，依法支付工资、经济补偿、补缴社保，并留存书面协议（如《解除劳动合同协议书》）。
  
• 对劳动者：若公司注销前未处理劳动关系，应及时向清算组申报债权；若已注销，可向股东或实际控制人主张权利，并保留劳动合同、工资条等证据。
  

总结：公司注销原则上导致劳动关系终止，但若注销程序违法或未依法处理劳动关系，劳动者仍可通过法律途径维权。如有具体纠纷，可直接向我咨询，我会结合案情提供详细方案。