结论：保密协议拒签被辞退是否有赔偿，需根据具体情况判断，主要包括辞退原因、保密协议内容以及相关法律法规的规定。以下是对此问题的详细分析：
一、辞退原因的影响
合法辞退无需赔偿：
- 如果用人单位因劳动者不符合录用条件、严重违反规章制度、严重失职或营私舞弊等法定情形辞退劳动者，且这些情形与保密协议的签订或拒签无直接关联，那么用人单位无需支付赔偿金。
违法辞退需支付赔偿金：
- 若用人单位无合法依据辞退劳动者，如不符合《劳动合同法》规定的解除情形，或因劳动者拒签保密协议而恶意辞退，则属于违法解除。此时，劳动者有权要求用人单位支付赔偿金，标准为经济补偿的二倍。经济补偿按劳动者在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资，六个月以上不满一年的按一年计算，不满六个月的支付半个月工资。
二、保密协议内容的影响
保密协议中的特殊条款：
- 如果保密协议中包含了关于拒签保密协议后果的特殊条款，如“拒签保密协议视为严重违反规章制度，用人单位有权解除劳动合同且无需支付经济补偿”，那么这些条款将影响劳动者的赔偿权益。但需要注意的是，此类条款必须合法、合理，且不得违反法律法规的强制性规定。
保密义务与辞退补偿的关联性：
- 保密协议主要约束劳动者在工作期间及离职后对用人单位商业秘密的保密义务。这一义务与辞退补偿的判定通常无直接关联。除非保密协议中明确规定了拒签保密协议将导致辞退且无补偿，否则用人单位不能仅因劳动者拒签保密协议而拒绝支付辞退补偿。
三、相关法律法规的规定
《中华人民共和国劳动合同法》：
- 该法规定了用人单位解除劳动合同的合法情形以及违法解除劳动合同的法律责任。劳动者在遭遇辞退时，可以依据该法判断用人单位的辞退行为是否合法，并据此主张自己的权益。
保密协议与竞业限制：
- 如果保密协议中包含了竞业限制条款，且劳动者在离职后遵守了该约定，那么用人单位需按照协议规定，在竞业限制期限内按月支付经济补偿给劳动者。这一补偿与劳动者是否被辞退无关，只要履行了竞业限制义务，即可获得。但需要注意的是，竞业限制条款与保密协议虽有关联，但并非同一概念，其法律后果也有所不同。
四、综合分析与建议
审查辞退原因：
- 劳动者在遭遇辞退时，应首先审查自己的辞退原因是否属于合法范畴。如果认为用人单位的辞退行为违法，可以收集相关证据并主张自己的权益。
仔细查阅保密协议：
- 劳动者应仔细查阅保密协议中的相关条款，特别是关于拒签保密协议后果的特殊条款。如果认为这些条款违法或不合理，可以寻求法律帮助并主张自己的权益。
及时咨询与维权：
- 在遭遇辞退时，劳动者应及时咨询专业律师（即我），了解自己的权利和义务，并根据自身情况采取合适的法律措施维护权益。如果用人单位拒绝支付赔偿金或经济补偿，劳动者可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。
示例说明：
假设劳动者因拒签保密协议而被用人单位辞退，且用人单位未提供合法依据。此时，劳动者可以主张用人单位违法解除劳动合同，并要求支付赔偿金。如果保密协议中未包含关于拒签保密协议后果的特殊条款，或者这些条款违法或不合理，那么劳动者的主张将更有依据。
计算公式（如涉及经济补偿或赔偿金）：
- 经济补偿：按劳动者在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的按一年计算；不满六个月的支付半个月工资。
- 赔偿金：经济补偿的二倍。
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