工厂“旷一扣三”的做法是否违法，需分情况讨论：
若工厂规章制度或劳动合同中有明确约定“旷一扣三”：
- 合法性分析：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。同时，该法第三十五条规定，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容。若工厂规章制度或劳动合同中明确约定了“旷一扣三”的处罚措施，并且该规章制度已经过民主程序制定（如职工代表大会或全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或职工代表平等协商确定），且已公示或告知劳动者，那么从形式上看，这一规定可能是合法的。但关键在于该规定是否合理，即是否超出了合理的处罚范围。
- 合理性判断：一般来说，“旷一扣三”的处罚措施较为严厉，可能超出了劳动者旷工一天所应承担的责任范围。根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。因此，“旷一扣三”可能因超出合理范围而被认定为违法。
若工厂规章制度或劳动合同中未明确约定“旷一扣三”：
- 合法性分析：若工厂规章制度或劳动合同中未明确约定“旷一扣三”的处罚措施，工厂擅自实施这一处罚，则缺乏法律依据，属于违法行为。
- 法律后果：劳动者有权要求工厂补发被扣除的工资，并可能依据《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条，以工厂未及时足额支付劳动报酬为由，提出解除劳动合同，并要求工厂支付经济补偿。
建议与风险提示：
- 对劳动者：若遇到工厂“旷一扣三”的情况，首先应查看工厂规章制度或劳动合同中是否有相关约定。若无约定或约定违法，可向工厂提出异议，要求补发工资。若工厂拒绝，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 对工厂：应依法制定规章制度，确保规章制度内容合法、合理，并经过民主程序制定和公示。在处罚劳动者时，应确保处罚措施与劳动者的过错程度相适应，避免过度处罚引发劳动争议。
总结：工厂“旷一扣三”的做法是否违法，取决于工厂规章制度或劳动合同中是否有明确约定，以及该约定是否合法、合理。若工厂擅自实施这一处罚措施，则可能面临法律风险。如有具体法律问题，可直接向我咨询。