当您发现工伤认定书被公司拿走后，为了有效保障自己的合法权益，您可以按照以下详细且具有深度的步骤来处理：
一、初步沟通与协商
友好沟通：
- 首先，尝试与公司的人力资源部门或负责工伤事宜的相关人员进行友好沟通。
- 明确告知公司，工伤认定书对您了解工伤情况、进行后续劳动能力鉴定以及申请工伤赔偿等环节都至关重要。
- 要求公司立即归还工伤认定书原件，或至少提供一份加盖公章的复印件。
保留沟通记录：
- 在沟通过程中，无论是面对面交流、电话沟通还是通过微信、邮件等方式，都要完整保留聊天记录或录音（在合法合规的前提下）。
- 这些沟通记录将作为后续维权的证据，证明您已经尝试与公司协商解决此事。
二、收集相关证据
工伤认定相关材料：
- 收集您申请工伤认定时提交的所有材料，如工伤认定申请表、医疗证明、事故报告等。
- 这些材料能够证明您确实进行了工伤认定，并且认定书已经出具。
与公司沟通的证据：
- 除了之前保留的沟通记录外，还可以收集其他能证明您与公司就工伤认定书进行过沟通的证据，如邮件往来、短信通知等。
三、向鉴定机构或相关部门申请协助
向工伤鉴定机构申请补领：
- 持本人有效身份证件前往工伤鉴定机构，说明情况并请求协助解决。
- 工伤鉴定机构通常会存档鉴定结果，您可以要求其重新出具一份工伤认定书或提供加盖公章的复印件。
向劳动行政部门反映：
- 如果公司拒绝归还工伤认定书，您可以向当地的劳动行政部门（如人力资源和社会保障局或劳动监察部门）反映情况。
- 提交您收集的相关证据，如工伤认定相关材料、与公司沟通的记录等，以证明工伤认定书原本在您手中且被公司拿走。
- 劳动行政部门会对此进行调查核实，并督促公司归还工伤认定书。
四、考虑法律途径
申请劳动仲裁：
- 如果上述方法均无法解决问题，您可以考虑向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。
- 撰写仲裁申请书，明确仲裁请求（即要求公司返还工伤认定书原件）、事实和理由，并准备好相关证据材料。
- 提交仲裁申请书及证据材料给劳动争议仲裁委员会，等待仲裁裁决。
提起诉讼：
- 如果对仲裁结果不满意，您可以在规定时间内向人民法院提起诉讼。
- 在诉讼过程中，您需要提交更详细的证据材料，并可能需要出庭作证。
- 法院会根据实际情况进行审理和判决，维护您的合法权益。
五、寻求专业法律帮助
- 在处理此类复杂问题时，如果您感到困惑或无助，可以寻求专业律师的帮助。
- 律师会为您提供专业的法律建议和指导，帮助您更好地制定维权策略，并代表您与公司或相关部门进行沟通协商。
六、重要提示与总结
- 在整个维权过程中，保留好相关证据是至关重要的。这些证据将作为您主张权益的依据，确保您的诉求得到支持。
- 同时，保持冷静和理性也是非常重要的。不要因为情绪激动而采取过激行为，这可能会影响您的维权效果。
- 记住，法律是保护劳动者权益的有力武器。合理运用法律途径，您将能够有效维护自己的合法权益。
总之，当工伤认定书被公司拿走后，您不要慌张。通过上述详细且具有深度的步骤来处理此事，您将能够有效地维护自己的合法权益。