结论：老板将打卡机故意调快三分钟，这一行为可能侵犯了劳动者的合法权益，具体是否构成侵权需结合实际情况判断。以下从不同角度进行分析：
一、从劳动时间与休息权的角度
劳动时间规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者每日工作时间不超过八小时，平均每周工作时间不超过四十四小时。用人单位应当保证劳动者每周至少休息一日。
- 如果打卡机被调快三分钟导致劳动者实际工作时间超出法定标准，或者影响了劳动者的正常休息时间，那么这一行为就可能违反了劳动法的规定，侵犯了劳动者的合法权益。
休息权保障：
- 劳动者有权享受法定的休息时间，包括工作日内的休息时间和周末的休息日。打卡机被调快可能间接剥夺了劳动者的这部分休息时间，从而构成侵权。
二、从诚实信用与公平原则的角度
诚实信用原则：
- 在劳动关系中，用人单位和劳动者应当遵循诚实信用原则，履行各自的义务。打卡机作为记录劳动者工作时间的工具，应当准确反映劳动者的实际工作时间。
- 老板故意调快打卡机，可能构成对诚实信用原则的违反，损害了劳动者的信任利益。
公平原则：
- 劳动关系应当遵循公平原则，确保双方的权利和义务相对平衡。打卡机被调快可能导致劳动者在不知情的情况下承担了更多的工作时间，而用人单位则可能因此获得不正当的利益。
- 这种行为破坏了劳动关系的公平性，可能构成对劳动者合法权益的侵犯。
三、从实际影响与救济措施的角度
实际影响：
- 打卡机被调快三分钟，虽然看似时间不长，但长期累积下来可能对劳动者的权益产生显著影响。例如，可能导致劳动者加班时间增加、工资计算不准确等。
救济措施：
- 如果劳动者发现打卡机被调快，应当及时与用人单位沟通，要求纠正这一行为。
- 如果用人单位拒绝纠正，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉，或者通过劳动争议仲裁、诉讼等途径维护自己的合法权益。
四、特殊情况考虑
- 如果打卡机被调快是由于技术故障或误操作导致的，且用人单位在发现后及时进行了纠正，并未对劳动者的权益造成实际影响，那么这一行为可能不构成侵权。
- 但如果用人单位明知打卡机被调快而故意不纠正，或者利用这一行为来损害劳动者的权益，那么就应当承担相应的法律责任。
建议：作为劳动者，如果发现打卡机被调快或其他可能侵犯自己权益的行为，应当及时保留证据（如打卡记录、与用人单位的沟通记录等），并向用人单位提出异议。如果用人单位不予理会或处理不当，可以向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助。同时，也可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。