合伙协议中约定违约金以出资额的20%计算，这样的条款在符合一定条件下是具有法律效应的。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据
根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条的规定，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。这意味着，在合伙协议中，双方有权就违约责任进行约定，包括违约金的数额或计算方式。
二、违约金约定的有效条件
双方自愿：违约金的约定必须是双方真实意思的表示，不存在欺诈、胁迫等情形。这是合同成立的基本原则，也是违约金条款有效的前提。
合法合理：约定的违约金数额应当合理，不能过高或过低。虽然法律没有明确规定违约金的具体比例或数额上限，但过高的违约金可能被视为显失公平，而过低的违约金则可能无法起到约束作用。在您提到的案例中，以出资额的20%作为违约金，这一比例本身并不违法，但具体是否合理还需根据合伙协议的具体内容、双方的投资比例、预期收益等因素综合判断。
不违反法律法规和公序良俗：违约金条款的内容不得违反法律法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。例如，不能约定因违约而剥夺一方的生命权、健康权等基本人权。
三、违约金的调整机制
即使合伙协议中明确约定了违约金的数额或计算方式，当约定的违约金数额过分高于或低于实际造成的损失时，当事人也有权请求人民法院或仲裁机构予以适当调整。法院或仲裁机构在调整违约金时，会综合考虑实际损失、合同履行情况、过错程度及预期利益等因素，依据公平原则和诚实信用原则进行裁决。
四、实践中的注意事项
明确约定内容：在签订合伙协议时，双方应明确约定违约金的具体数额或计算方式，以及违约的具体情形和后果。这有助于减少未来可能产生的争议和纠纷。
保留证据：为了维护自己的合法权益，双方应妥善保管与合伙协议履行相关的证据，如转账记录、收据、聊天记录、会议纪要等。这些证据在发生纠纷时将起到至关重要的作用。
及时寻求法律帮助：如果一方未按照合伙协议的约定履行义务或违反其他约定条款，另一方应及时寻求法律帮助，通过诉讼或仲裁等方式维护自己的权益。
总结来说，合伙协议中约定违约金以出资额的20%计算，在符合双方自愿、合法合理且不违反法律法规和公序良俗的条件下，是具有法律效应的。但具体是否合理还需根据合伙协议的具体内容、双方的投资比例、预期收益等因素综合判断。如果您在合伙协议签订或履行过程中遇到任何法律问题，可以直接向我咨询。